RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 UBDO15205 165 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MSH4O15457 936 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TMPRSS11DO60235 418 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CCNKO75909 580 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TOXO94900 526 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 OR2F2O95006 317 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 OR4F21O95013 312 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 KLHL2O95198 593 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 HPRP00739 348 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 IGHG3P01860 377 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CCDC166P0CW27 439 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ETFAP13804 333 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TPSB2P20231 275 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NTF3P20783 257 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CFPP27918 469 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ALDH3B1P43353 468 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NR4A2P43354 598 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CBX5P45973 191 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GCLMP48507 274 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 C21orf59P57076 290 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CXADRP78310 365 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NME3Q13232 169 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MED21Q13503 144 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 EMC2Q15006 297 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PTPRRQ15256 657 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TPSAB1Q15661 275 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SYT14P1Q58G82 188 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PHYHD1Q5SRE7 291 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FAM182AQ5T1J6 154 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CCNJQ5T5M9 372 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 LIPNQ5VXI9 398 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FAM131AQ6UXB0 335 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CD163Q86VB7 1156 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DHFR2Q86XF0 187 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 HIPK1Q86Z02 1210 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC34Q8IZ02 419 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RBFAQ8N0V3 343 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CADM2Q8N3J6 435 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CCNYL1Q8N7R7 359 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 KIAA0895Q8NCT3 520 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FAM3CQ92520 227 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 HAS2Q92819 552 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SDSLQ96GA7 329 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SENP8Q96LD8 212 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MFFQ9GZY8 342 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SLA2Q9H6Q3 261 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PRDM7Q9NQW5 492 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DUSP22Q9NRW4 184 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ASF1BQ9NVP2 202 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FZD10Q9ULW2 581 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PYCARDQ9ULZ3 195 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 HYDINQ4G0P3 5121 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 AKAP6Q13023 2319 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 WWP2O00308 870 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CHEK1O14757 476 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 APRTP07741 180 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SFTPBP07988 381 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FBLP22087 321 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 SLC2A5P22732 501 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PROZP22891 400 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 F8A1P23610 371 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DGKAP23743 735 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DUTP33316 252 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RPS5P46782 204 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 OR2B6P58173 313 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MLF1P58340 268 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 DLG1Q12959 904 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 STX5Q13190 355 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 FAM83EQ2M2I3 478 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 LRRC38Q5VT99 294 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM268Q5VZI3 342 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GCNT7Q6ZNI0 430 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 LHFPL3Q86UP9 236 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CYP4Z1Q86W10 505 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 EID3Q8N140 333 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NRGNQ92686 78 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 GGHQ92820 318 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 MOB3AQ96BX8 217 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PLEKHA8Q96JA3 519 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 OR2M2Q96R28 347 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 ZSWIM1Q9BR11 485 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 NUDT9Q9BW91 350 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 TSSK1BQ9BXA7 367 aa2.29□□□□□ -2.04
CCSAP-202ENST00000366686 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms