RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361530.10

CNKSR1-201, Transcript of connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNKSR1, Length 2,625 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1-201ENST00000361530 KLHL36Q8N4N3 616 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 YIPF7Q8N8F6 280 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 OR4E2Q8NGC2 313 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 BADQ92934 168 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 SNAPC3Q92966 411 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 SARGQ9BW04 601 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 ENKD1Q9H0I2 346 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 ACOXLQ9NUZ1 547 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 CALML5Q9NZT1 146 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 TRANK1O15050 2925 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 ARHGEF9O43307 516 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 EML2O95834 649 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 HLA-DPB1P04440 258 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 FCARP24071 287 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 HTR1FP30939 366 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 TMEM240Q5SV17 173 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 CCNJQ5T5M9 372 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 MFSD12Q6NUT3 480 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 NRROSQ86YC3 692 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 GJD3Q8N144 294 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 SPERTQ8NA61 448 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 OR51G2Q8NGK0 314 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 NR4A3Q92570 626 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 ART5Q96L15 291 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 MED20Q9H944 212 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa14.49□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 PRG2P13727 222 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 IFNA8P32881 189 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 MAP2K3P46734 347 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 CTBP2P56545 445 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 IL18Q14116 193 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 EFR3AQ14156 821 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 PLET1Q6UQ28 207 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 GANCQ8TET4 914 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 UBQLN3Q9H347 655 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 TMEM74BQ9NUR3 256 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 A0A0G2JMP0 313 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 BTN3A3O00478 584 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 HRO43593 1189 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 ICMTO60725 284 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 HLA-DQB1P01920 261 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 PSKH1P11801 424 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 NDUFV2P19404 249 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 CMPK1P30085 196 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 IGFALSP35858 605 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 GCGRP47871 477 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 FAPQ12884 760 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 RUNX3Q13761 415 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 TRIQKQ629K1 86 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 PLBD1Q6P4A8 553 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 ZNF836Q6ZNA1 936 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 OR2T33Q8NG76 320 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 TIMP4Q99727 224 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 CDH10Q9Y6N8 788 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 SCN2AQ99250 2005 aa14.48□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 A0A1W2PQU0 124 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 J3QRE1 110 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 OR5F1O95221 314 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 FAM157BP0CG42 384 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 ZNF136P52737 540 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 FXYD6P3P58550 94 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 ACSM1Q08AH1 577 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 SGCGQ13326 291 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 DUSP5Q16690 384 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 TATDN3Q17R31 274 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 WDR88Q6ZMY6 472 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 MTSS1LQ765P7 747 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 OR52N1Q8NH53 320 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 ARSGQ96EG1 525 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 TBX5Q99593 518 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 PRSS27Q9BQR3 290 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 HCAR1Q9BXC0 346 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 SLC6A17Q9H1V8 727 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 NLKQ9UBE8 527 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 WDR45Q9Y484 360 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 A0A0X1KG70 313 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 AKR7A2O43488 359 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 HCN1O60741 890 aa14.47□□□□□ -0.09
CNKSR1-201ENST00000361530 IFI30P13284 250 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms