RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 LPLP06858 475 aa13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 IGFBP5P24593 272 aa13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 BLKP51451 505 aa13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 CSNK1G2P78368 415 aa13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 COMMD6Q7Z4G1 85 aa13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 IQCHQ86VS3 1027 aa13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 COQ8AQ8NI60 647 aa13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF675Q8TD23 568 aa13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 SFT2D1Q8WV19 159 aa13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 SLC22A18Q96BI1 424 aa13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 DIRAS2Q96HU8 199 aa13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 MS4A8Q9BY19 250 aa13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 BIN3Q9NQY0 253 aa13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 IMPAD1Q9NX62 359 aa13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 ASB4Q9Y574 426 aa13.77□□□□□ -0.2
HOXA3-201ENST00000317201 PDCD5O14737 125 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 HRO43593 1189 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 CLEC3AO75596 197 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 CD27P26842 260 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 AK4P27144 223 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 DCTP40126 519 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 NLRC3Q7RTR2 1065 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 RD3Q7Z3Z2 195 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 SLC34A3Q8N130 599 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF740Q8NDX6 193 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC115Q96NT0 180 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 VAPAQ9P0L0 249 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 BTNL2Q9UIR0 455 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 ADAM29Q9UKF5 820 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 METTL12A8MUP2 240 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 ABCD4O14678 606 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 PRAMEF10O60809 474 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 PTHP01270 115 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 THEGLP0DJG4 465 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 PSMB5P28074 263 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 SLC19A1P41440 591 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 P2RY4P51582 365 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 FGL1Q08830 312 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 FZD2Q14332 565 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 SEC23BQ15437 767 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 DUOXA1Q1HG43 343 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 ANXA8L1Q5VT79 327 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 FCRLBQ6BAA4 426 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 SLC9B2Q86UD5 537 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 PHACTR4Q8IZ21 702 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 DEFB123Q8N688 67 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 NUDT8Q8WV74 236 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM68Q96MH6 324 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 PPM1MQ96MI6 270 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 RDH12Q96NR8 316 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 DNAJB9Q9UBS3 223 aa13.77□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 PQLC2LA1A4F0 135 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 FAM221BA6H8Z2 402 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 H7BY64 318 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 SCN2BO60939 215 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 TGFB1P01137 390 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 COX7A2P14406 83 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 PTPN6P29350 595 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 CMPK1P30085 196 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 AHRP35869 848 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 RGS6P49758 472 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 PDE7AQ13946 482 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 MICAQ29983 383 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 GTDC1Q4AE62 458 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 FAM74A1Q5RGS3 127 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 MSRB3Q8IXL7 192 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 OR2L3Q8NG85 312 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 LCN9Q8WX39 176 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 LRRC46Q96FV0 321 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 KLHDC7BQ96G42 594 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 PRAP1Q96NZ9 151 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF251Q9BRH9 671 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 MND1Q9BWT6 205 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 FOXQ1Q9C009 403 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 XKR8Q9H6D3 395 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 POT1Q9NUX5 634 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 MBD2Q9UBB5 411 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 A0A0G2JNG1 304 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa13.76□□□□□ -0.21
HOXA3-201ENST00000317201 KRBOX1C9JBD0 128 aa13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms