RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295887.5

CDS1-201, Transcript of CDP-diacylglycerol synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CDS1, Length 4,461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS1-201ENST00000295887 GABRPO00591 440 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 BPIFA2Q96DR5 249 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 RNF13O43567 381 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 PVRP15151 417 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 KCNJ5P48544 419 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 SMCO1Q147U7 214 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 UBXN2BQ14CS0 331 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 C15orf40Q8WUR7 153 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 SLC6A15Q9H2J7 730 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 BABAM2Q9NXR7 383 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 KCMF1Q9P0J7 381 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 CENPBD1B2RD01 187 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 MMP11P24347 488 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 CCKBRP32239 447 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 SLC1A3P43003 542 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 OR3A3P47888 321 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 OR3A2P47893 321 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 LTB4RQ15722 352 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 PYHIN1Q6K0P9 492 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 FOXRED2Q8IWF2 684 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 C4orf36Q96KX1 117 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 ARL6Q9H0F7 186 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 STARD5Q9NSY2 213 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa15.6■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 SLC5A10A0PJK1 596 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 XCR1P46094 333 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 OR5K2Q8NHB8 316 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 NEK7Q8TDX7 302 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 FBXO8Q9NRD0 319 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 GPX5O75715 221 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 AHSA1O95433 338 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 CFL1P23528 166 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 ATP5A1P25705 553 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 UQCRC1P31930 480 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 EMP3P54852 163 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 TSPAN31Q12999 210 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 NECTIN4Q96NY8 510 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 ABCG4Q9H172 646 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 SIRT5Q9NXA8 310 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 TAAR2Q9P1P5 351 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 DOCK1Q14185 1865 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 TRIM3O75382 744 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 ZNF432O94892 652 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 PRKCAP17252 672 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 B4GALNT1Q00973 533 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 PUDPQ08623 228 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 GDPD3Q7L5L3 318 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 RIT1Q92963 219 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 RXFP3Q9NSD7 469 aa15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa15.58■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa15.58■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 RNH1P13489 461 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 GPR143P51810 404 aa15.58■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 ACTA2P62736 377 aa15.58■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 ACTG2P63267 376 aa15.58■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 SWI5Q1ZZU3 235 aa15.58■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 SLX4IPQ5VYV7 408 aa15.58■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 LEG1Q6P5S2 330 aa15.58■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa15.58■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 CDRT4Q8N9R6 151 aa15.58■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 LYSMD1Q96S90 227 aa15.58■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 CSF3RQ99062 836 aa15.58■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.58■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa15.58■□□□□ 0.09
CDS1-201ENST00000295887 RAD1O60671 282 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 ADAM23O75077 832 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 GP1BBP13224 206 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 GIFP27352 417 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 PLK5Q496M5 336 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 WASH2PQ6VEQ5 465 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 OR52I1Q8NGK6 324 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 UBQLN2Q9UHD9 624 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 SH2B3Q9UQQ2 575 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 PPM1BO75688 479 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 PLGP00747 810 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 IRF4Q15306 451 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 KCTD9Q7L273 389 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 FGF13Q92913 245 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 PRELID1Q9Y255 219 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 ATG4BQ9Y4P1 393 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 PCDHGB2Q9Y5G2 931 aa15.58■□□□□ 0.08
CDS1-201ENST00000295887 SCO2O43819 266 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms