RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 FAM25CB3EWG5 89 aa26.09■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 FAM25GB3EWG6 89 aa26.09■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 THBS1P07996 1170 aa26.09■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 TNFRSF17Q02223 184 aa26.09■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa26.09■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 PAQR7Q86WK9 346 aa26.09■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 UBE2J2Q8N2K1 259 aa26.09■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 SIRT6Q8N6T7 355 aa26.09■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa26.09■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 PHF11Q9UIL8 331 aa26.09■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 SOCS6O14544 535 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 LYRM1O43325 122 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 NCR1O76036 304 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 SLC2A10O95528 541 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 WASP42768 502 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 MTNR1BP49286 362 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 DUSP8Q13202 625 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 FZD5Q13467 585 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 TATDN3Q17R31 274 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 TMEM91Q6ZNR0 172 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 LIX1LQ8IVB5 337 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 OR2L13Q8N349 312 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 NT5CQ8TCD5 201 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 CD8B2A6NJW9 211 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 CDC42EP2O14613 210 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 FAM157BP0CG42 384 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 CD8BP10966 210 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 PSKH1P11801 424 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 PAICSP22234 425 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 ALAS2P22557 587 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 VN1R4Q7Z5H5 301 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 TRIM48Q8IWZ4 208 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 ACBD7Q8N6N7 88 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 KCT2Q8NC54 265 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 MALT1Q9UDY8 824 aa26.08■■□□□ 1.77
UBP1-201ENST00000283628 RNF13O43567 381 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 ADAM15Q13444 863 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 MADCAM1Q13477 382 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 C2orf27AQ580R0 203 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 ASPGQ86U10 573 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 YIPF2Q9BWQ6 316 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 PTGFRNQ9P2B2 879 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 EPOPA6NHQ4 379 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 UNC119BA6NIH7 251 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 ZNF136P52737 540 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 CLDN20P56880 219 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 CD83Q01151 205 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 NIPAL3Q6P499 406 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 ZNF438Q7Z4V0 828 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 AMIGO1Q86WK6 493 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 OR4K14Q8NGD5 310 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 OR52L1Q8NGH7 329 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 OR51G2Q8NGK0 314 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 PBX4Q9BYU1 374 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 BABAM2Q9NXR7 383 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 IL20RAQ9UHF4 553 aa26.07■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 TRAPPC13A5PLN9 417 aa26.06■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 ZNF24P17028 368 aa26.06■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 IGFALSP35858 605 aa26.06■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 INPP1P49441 399 aa26.06■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 RACK1P63244 317 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 YIF1BQ5BJH7 314 aa26.06■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 NUDT18Q6ZVK8 323 aa26.06■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 FCRL4Q96PJ5 515 aa26.06■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 SLC17A9Q9BYT1 436 aa26.06■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 OR52D1Q9H346 318 aa26.06■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 IGFLR1Q9H665 355 aa26.06■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 PRDM9Q9NQV7 894 aa26.06■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa26.05■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 ANKRD34BA5PLL1 514 aa26.05■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 ERP29P30040 261 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 SMARCD3Q6STE5 483 aa26.05■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 TRILQ7L0X0 811 aa26.05■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 GRPEL2Q8TAA5 225 aa26.05■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 FANK1Q8TC84 345 aa26.05■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 COL26A1Q96A83 441 aa26.05■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 PRSS27Q9BQR3 290 aa26.05■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 MARVELD1Q9BSK0 173 aa26.05■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 APOOQ9BUR5 198 aa26.05■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 ALG5Q9Y673 324 aa26.05■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 A6NL46 340 aa26.05■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 C12orf71A8MTZ7 269 aa26.05■■□□□ 1.76
UBP1-201ENST00000283628 ZGLP1P0C6A0 271 aa26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms