RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 OR5M9Q8NGP3 310 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 CCDC120Q96HB5 630 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 TIMP4Q99727 224 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ZNF350Q9GZX5 532 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 SAP130Q9H0E3 1048 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 TPT1P8Q9HAU6 139 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 SDHAF3Q9NRP4 125 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 TRIM33Q9UPN9 1127 aa20.25■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 PTPN13Q12923 2485 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 NR5A2O00482 541 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 BCKDKO14874 412 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 AK1P00568 194 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 BMP7P18075 431 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 DCTP40126 519 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 CLK3P49761 638 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 GFRA1P56159 465 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 B3GALT5-AS1P59052 145 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ADORA2A-AS1P86434 159 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 TOMM20Q15388 145 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 DCST1Q5T197 706 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 RPRMLQ8N4K4 120 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 MARVELD2Q8N4S9 558 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 GATSQ8NAP1 163 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ZG16BQ96DA0 208 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 HOXD1Q9GZZ0 328 aa20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ICE1Q9Y2F5 2266 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 A0A096LPI6 279 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PP18 115 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 OIP5O43482 229 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 NDUFB5O43674 189 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ATP6V1C1P21283 382 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 DPP4P27487 766 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 KHKP50053 298 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 GYS2P54840 703 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 FLYWCH1Q4VC44 716 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 C6orf10Q5SRN2 563 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 RTL6Q6ICC9 239 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 OR4K17Q8NGC6 315 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 C10orf82Q8WW14 230 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 SARAFQ96BY9 339 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ROPN1LQ96C74 230 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 UGT2B28Q9BY64 529 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 NMUR2Q9GZQ4 415 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 RABEP2Q9H5N1 569 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 EXO5Q9H790 373 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 EXD2Q9NVH0 621 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R10Q9NYW0 307 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 KLHL14Q9P2G3 628 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ACAD8Q9UKU7 415 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 MKLN1Q9UL63 735 aa20.23■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 E9PLN8 166 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ZG16O60844 167 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 STX11O75558 287 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 UGT2B17O75795 530 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 KRT75O95678 551 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 AGR2O95994 175 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 CASP6P55212 293 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ZNF141Q15928 474 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 MAPK14Q16539 360 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 SYPL1Q16563 259 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 DLEU7Q6UYE1 221 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 FRRS1Q6ZNA5 592 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 RETREG3Q86VR2 466 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ANKFN1Q8N957 763 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 VKORC1Q9BQB6 163 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 FAM215AQ9Y5M1 114 aa20.22■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 SCDO00767 359 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ANP32DO95626 131 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ETFAP13804 333 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 SEC24CP53992 1094 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 GPR68Q15743 365 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ARSKQ6UWY0 536 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 C16orf62Q7Z3J2 963 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 OR14L1PQ8NHC6 308 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 WDYHV1Q96HA8 205 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 PRDM14Q9GZV8 571 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 SAR1AQ9NR31 198 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 VAPAQ9P0L0 249 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 DTNAQ9Y4J8 743 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 GMEB1Q9Y692 573 aa20.21■□□□□ 0.83
SYF2-201ENST00000236273 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 HEATR5AQ86XA9 2040 aa20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms