RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640021.1

NOTCH2-208, Transcript of notch 2, humanhuman

TSL 5

Gene NOTCH2, Length 2,058 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2-208ENST00000640021 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
NOTCH2-208ENST00000640021 KAZALD1Q96I82 304 aa14.78□□□□□ -0.04
NOTCH2-208ENST00000640021 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
NOTCH2-208ENST00000640021 TERF1P54274 439 aa14.77□□□□□ -0.04
NOTCH2-208ENST00000640021 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.77□□□□□ -0.04
NOTCH2-208ENST00000640021 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.77□□□□□ -0.04
NOTCH2-208ENST00000640021 SNRKQ9NRH2 765 aa14.77□□□□□ -0.04
NOTCH2-208ENST00000640021 SCN11AQ9UI33 1791 aa14.77□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 ANKRD1Q15327 319 aa14.77□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.77□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 ERBB3P21860 1342 aa14.76□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 LARGE1O95461 756 aa14.76□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 FSD1Q9BTV5 496 aa14.76□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 IGKV5-2P06315 115 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 GCKRQ14397 625 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 FAM227BQ96M60 508 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 SIL1Q9H173 461 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 MTMR6Q9Y217 621 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 MST1RQ04912 1400 aa14.75□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 SLC27A2O14975 620 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 FIBPO43427 364 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 MYL6BP14649 208 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 TRHP20396 242 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 PDCP20941 246 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 ME3Q16798 604 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.054e-6■□□□□ 10.6
NOTCH2-208ENST00000640021 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 C5P01031 1676 aa14.74□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 SLC39A6Q13433 755 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 COPS6Q7L5N1 327 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 NLRP2Q9NX02 1062 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 PHKG2P15735 406 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 MYD88Q99836 296 aa14.73□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 MRC1P22897 1456 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 COPRSQ9NQ92 184 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 A0A0D9SFI3 127 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 TPCN1Q9ULQ1 816 aa14.72□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 MED23Q9ULK4 1368 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 RPS6KB1P23443 525 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 KRT32Q14532 448 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 ALS2Q96Q42 1657 aa14.71□□□□□ -0.05
NOTCH2-208ENST00000640021 ATP5JP18859 108 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 NECAB1Q8N987 351 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 ABCC6O95255 1503 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 KRT85P78386 507 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 TPRNQ4KMQ1 711 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 DCAF5Q96JK2 942 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 COL15A1P39059 1388 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 JCADQ9P266 1359 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 ST3GAL1Q11201 340 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 TNNI3KQ59H18 835 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.69□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 ELP1O95163 1332 aa14.68□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 TAF5LO75529 589 aa14.68□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 USPL1Q5W0Q7 1092 aa14.68□□□□□ -0.06
NOTCH2-208ENST00000640021 USP25Q9UHP3 1055 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms