RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.34■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 H7C1W4 665 aa22.33■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.33■■□□□ 1.17
CLN8-211ENST00000636934 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.33■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.33■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 MRE11P49959 708 aa22.32■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.32■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 SNRKQ9NRH2 765 aa22.32■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 ATP5JP18859 108 aa22.31■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 TNNI3KQ59H18 835 aa22.31■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.31■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 KCNB2Q92953 911 aa22.31■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 FSD1Q9BTV5 496 aa22.31■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.31■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.31■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.31■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.31■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 MCTP1Q6DN14 999 aa22.3■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.3■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.3■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 A1BGP04217 495 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 TTC14Q96N46 770 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.29■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 TFCP2Q12800 502 aa22.28■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.28■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.28■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 BRD1O95696 1058 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 FOXO4P98177 505 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 PKP1Q13835 747 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 RASEFQ8IZ41 740 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 KCNJ4P48050 445 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 RNF20Q5VTR2 975 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 TICAM2Q86XR7 235 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 GPR108Q9NPR9 543 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.27■■□□□ 1.16
CLN8-211ENST00000636934 PTH1RQ03431 593 aa22.26■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 VPS53Q5VIR6 699 aa22.26■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 MAP4K1Q92918 833 aa22.26■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 ATG3Q9NT62 314 aa22.26■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.26■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 TJP1Q07157 1748 aa22.26■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 NECTIN1Q15223 517 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 BTG4Q9NY30 223 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.157e-9■■■■■ 47.1
CLN8-211ENST00000636934 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 PSMA5P28066 241 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.25■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 STARD3NLO95772 234 aa22.24■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 AK2P54819 239 aa22.24■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.24■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 MED23Q9ULK4 1368 aa22.23■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 FAM227BQ96M60 508 aa22.23■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.23■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.23■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.23■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 TCIRG1Q13488 830 aa22.22■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.22■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 HAUS7Q99871 368 aa22.22■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.22■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 DISP2A7MBM2 1401 aa22.22■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 CIAO1O76071 339 aa22.22■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 LRP6O75581 1613 aa22.22■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 JCADQ9P266 1359 aa22.21■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 A0A0D9SFI3 127 aa22.21■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 RUFY3Q7L099 469 aa22.21■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 FBXO3Q9UK99 471 aa22.21■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.2■■□□□ 1.15
CLN8-211ENST00000636934 PIGBQ92521 554 aa22.2■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.2■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 EYA2O00167 538 aa22.2■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 MBD3O95983 291 aa22.2■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CLN8-211ENST00000636934 SLC27A2O14975 620 aa22.19■■□□□ 1.14
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