RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614927.1

NPIPB11-202, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B11, humanhuman

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Gene NPIPB11, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11-202ENST00000614927 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
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NPIPB11-202ENST00000614927 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
NPIPB11-202ENST00000614927 GCKRQ14397 625 aa18.63■□□□□ 0.57
NPIPB11-202ENST00000614927 PDE3AQ14432 1141 aa18.63■□□□□ 0.57
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NPIPB11-202ENST00000614927 CARMIL3Q8ND23 1372 aa18.62■□□□□ 0.57
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NPIPB11-202ENST00000614927 USP44Q9H0E7 712 aa18.58■□□□□ 0.56
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NPIPB11-202ENST00000614927 H7C1W4 665 aa18.57■□□□□ 0.56
NPIPB11-202ENST00000614927 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
NPIPB11-202ENST00000614927 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP18.57■□□□□ 0.56
NPIPB11-202ENST00000614927 ST5P78524 1137 aa18.57■□□□□ 0.56
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NPIPB11-202ENST00000614927 MEIS3Q99687 375 aa18.57■□□□□ 0.56
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NPIPB11-202ENST00000614927 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11-202ENST00000614927 KLHL34Q8N239 644 aa18.56■□□□□ 0.56
NPIPB11-202ENST00000614927 DDX19BQ9UMR2 479 aa18.56■□□□□ 0.56
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NPIPB11-202ENST00000614927 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11-202ENST00000614927 GNAI3P08754 354 aa18.54■□□□□ 0.56
NPIPB11-202ENST00000614927 NEFLP07196 543 aa18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11-202ENST00000614927 CASP7P55210 303 aa18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11-202ENST00000614927 SUCLG2Q96I99 432 aa18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11-202ENST00000614927 SGIP1Q9BQI5 828 aa18.53■□□□□ 0.56
NPIPB11-202ENST00000614927 ABCC12Q96J65 1359 aa18.53■□□□□ 0.56
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NPIPB11-202ENST00000614927 C1orf115Q9H7X2 142 aa18.52■□□□□ 0.56
NPIPB11-202ENST00000614927 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
NPIPB11-202ENST00000614927 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa18.52■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 UTYO14607 1347 aa18.51■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 CDHR2Q9BYE9 1310 aa18.51■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 PDE8AO60658 829 aa18.51■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 SLC10A5Q5PT55 438 aa18.51■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 C3orf67Q6ZVT6 689 aa18.51■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 GNAI2P04899 355 aa18.5■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 EPHA10Q5JZY3 1008 aa18.5■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 NLRP3Q96P20 1036 aa18.5■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 BRIP1Q9BX63 1249 aa18.5■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 HDAC5Q9UQL6 1122 aa18.5■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 CHMP3Q9Y3E7 222 aa18.5■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa18.49■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 PDE6BP35913 854 aa18.48■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 FOXO4P98177 505 aa18.48■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 LMBR1LQ6UX01 489 aa18.48■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 KAZALD1Q96I82 304 aa18.48■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 COL24A1Q17RW2 1714 aa18.48■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 CTSWP56202 376 aa18.47■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 C2CD5Q86YS7 1000 aa18.47■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 PLA2G12BQ9BX93 195 aa18.47■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 ANKRD44Q8N8A2 993 aa18.46■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 TTLL11Q8NHH1 800 aa18.46■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
NPIPB11-202ENST00000614927 H0YIN7 160 aa18.45■□□□□ 0.54
NPIPB11-202ENST00000614927 CHRNA5P30532 468 aa18.45■□□□□ 0.54
NPIPB11-202ENST00000614927 CCDC152Q4G0S7 254 aa18.45■□□□□ 0.54
NPIPB11-202ENST00000614927 C10orf71Q711Q0 1435 aa18.44■□□□□ 0.54
NPIPB11-202ENST00000614927 A0A0G2JLW4 131 aa18.44■□□□□ 0.54
NPIPB11-202ENST00000614927 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
NPIPB11-202ENST00000614927 GREM2Q9H772 168 aa18.44■□□□□ 0.54
NPIPB11-202ENST00000614927 CD2APQ9Y5K6 639 aa18.44■□□□□ 0.54
NPIPB11-202ENST00000614927 CSF1RP07333 972 aa18.43■□□□□ 0.54
NPIPB11-202ENST00000614927 DPEP1P16444 411 aa18.43■□□□□ 0.54
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