RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A1BGP04217 495 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.48■■□□□ 1.19
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PAPPAQ13219 1627 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.47■■□□□ 1.19
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PKP1Q13835 747 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.46■■□□□ 1.19
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TNNI3KQ59H18 835 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MCTP1Q6DN14 999 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FSD1Q9BTV5 496 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SNRKQ9NRH2 765 aa22.45■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATP5JP18859 108 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TFCP2Q12800 502 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KLHL40Q2TBA0 621 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RASEFQ8IZ41 740 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KCNB2Q92953 911 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SHANK3Q9BYB0 1731 aa22.44■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FOXO4P98177 505 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PTH1RQ03431 593 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTC14Q96N46 770 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BTG4Q9NY30 223 aa22.43■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRE11P49959 708 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM227BQ96M60 508 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.41■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BRD1O95696 1058 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NECTIN1Q15223 517 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KCNJ4P48050 445 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAP4K1Q92918 833 aa22.4■■□□□ 1.18
HOXC-AS2-202ENST00000604081 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 AK2P54819 239 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LMBRD1Q9NUN5 540 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NUP188Q5SRE5 1749 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VPS53Q5VIR6 699 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATG3Q9NT62 314 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 STARD3NLO95772 234 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PIGBQ92521 554 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GPR108Q9NPR9 543 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RNF20Q5VTR2 975 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A0D9SFI3 127 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TCIRG1Q13488 830 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PSMA5P28066 241 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ARXQ96QS3 562 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MED23Q9ULK4 1368 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RUFY3Q7L099 469 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HAUS7Q99871 368 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DISP2A7MBM2 1401 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CIAO1O76071 339 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TICAM2Q86XR7 235 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EYA2O00167 538 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC27A2O14975 620 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.33■■□□□ 1.17
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TJP1Q07157 1748 aa22.32■■□□□ 1.16
HOXC-AS2-202ENST00000604081 JCADQ9P266 1359 aa22.32■■□□□ 1.16
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