RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593068.6

TMEM259-211, Transcript of transmembrane protein 259, humanhuman

TSL 5

Gene TMEM259, Length 1,965 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259-211ENST00000593068 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.03■■□□□ 1.12
TMEM259-211ENST00000593068 CASP7P55210 303 aa22.02■■□□□ 1.12
TMEM259-211ENST00000593068 HSCBQ8IWL3 235 aa22.02■■□□□ 1.12
TMEM259-211ENST00000593068 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.01■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 TCIRG1Q13488 830 aa22.01■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 MTX1Q13505 466 aa22.01■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.01■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.01■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 NUP98P52948 1817 aa21.99■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 GPTP24298 496 aa21.99■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 SMIM5Q71RC9 77 aa21.99■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.99■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 KIF2CQ99661 725 aa21.99■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 CHMP5Q9NZZ3 219 aa21.99■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 H7C1W4 665 aa21.98■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 RAB11FIP3O75154 756 aa21.98■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 PDE1AP54750 535 aa21.98■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 CCDC191Q8NCU4 936 aa21.98■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.98■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 SDSP20132 328 aa21.98■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 LY75O60449 1722 aa21.97■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.97■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 DDIT3P35638 169 aa21.96■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.96■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 AOX1Q06278 1338 aa21.96■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.96■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
TMEM259-211ENST00000593068 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.94■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 STAP2Q9UGK3 403 aa21.94■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 COL15A1P39059 1388 aa21.94■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.94■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 FOXO4P98177 505 aa21.94■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 SYNE4Q8N205 404 aa21.94■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.94■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 TAF1LQ8IZX4 1826 aa21.93■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 MX1P20591 662 aa21.93■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 NLRP10Q86W26 655 aa21.93■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 FAM89AQ96GI7 184 aa21.93■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.93■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.92■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 TRIM37O94972 964 aa21.92■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 CAMTA2O94983 1202 aa21.92■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 REC8O95072 547 aa21.92■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.92■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.92■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.92■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.92■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 FBXO41Q8TF61 875 aa21.92■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 SIL1Q9H173 461 aa21.92■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa21.92■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 MCM4P33991 863 aa21.91■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.91■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 USP26Q9BXU7 913 aa21.9■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.9■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 LRRC4BQ9NT99 713 aa21.9■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.9■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 BCORQ6W2J9 1755 aa21.9■■□□□ 1.1
TMEM259-211ENST00000593068 RABEP1Q15276 862 aa21.89■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.89■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 ERC2O15083 957 aa21.88■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.88■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.88■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 GNPATO15228 680 aa21.88■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 RXRBP28702 533 aa21.88■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 C4BP0C0L5 1744 aa21.87■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 POTEAQ6S8J7 498 aa21.87■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 FAM177BA6PVY3 158 aa21.87■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 SASH1O94885 1247 aa21.87■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 SUSD4Q5VX71 490 aa21.85■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.85■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 IL27Q8NEV9 243 aa21.85■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 RPS6KA4O75676 772 aa21.84■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 COPRSQ9NQ92 184 aa21.84■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 SCN7AQ01118 1682 aa21.84■■□□□ 1.09
TMEM259-211ENST00000593068 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms