RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 IP6K1Q92551 441 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 LMTK3Q96Q04 1460 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 CACNA1FO60840 1977 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 SLIT3O75094 1523 aa11.35□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 FOXO3O43524 673 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 RABEP1Q15276 862 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 KRT24Q2M2I5 525 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 NKX2-3Q8TAU0 364 aa11.34□□□□□ -0.59
EFTUD2-222ENST00000592408 LMO7Q8WWI1 1683 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 REC8O95072 547 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 PSME1Q06323 249 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 FLIIQ13045 1269 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC4A10Q6U841 1118 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 MEIS3Q99687 375 aa11.33□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 AMOTQ4VCS5 1084 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 GBP4Q96PP9 640 aa11.32□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 KDM3BQ7LBC6 1761 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 NUTM2GQ5VZR2 741 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 AOX1Q06278 1338 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 MCM4P33991 863 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 PTGDRQ13258 359 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 ESCO1Q5FWF5 840 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 IL27Q8NEV9 243 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 OSBPL3Q9H4L5 887 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 IL21Q9HBE4 155 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 MIS18AQ9NYP9 233 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 HDAC5Q9UQL6 1122 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 MST1RQ04912 1400 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 MCCP23508 829 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 AKAP4Q5JQC9 854 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRCC1Q9C099 1032 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 ABCC6O95255 1503 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLGA6L22H0YM25 854 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 LCE2BO14633 110 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 ERC2O15083 957 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 TEFQ10587 303 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 G2E3Q7L622 706 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 IL17REQ8NFR9 667 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-222ENST00000592408 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 F6X3S4 739 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB11FIP3O75154 756 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 SDSP20132 328 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 DDIT3P35638 169 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 COPS2P61201 443 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 ATP8B2P98198 1209 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 DCCP43146 1447 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 SEMA3EO15041 775 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 MX1P20591 662 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 KIF2CQ99661 725 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 APBB1O00213 710 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 PDE1AP54750 535 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 RAB3GAP1Q15042 981 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 USHBP1Q8N6Y0 703 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKD2Q9BZL6 878 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 ZBTB7CA1YPR0 619 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 MCM2P49736 904 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 NUCB2P80303 420 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 NBPF6Q5VWK0 638 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZNB5 142 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 ARHGEF25Q86VW2 580 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 NBPF4Q96M43 638 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 USP26Q9BXU7 913 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 C1orf167Q5SNV9 1468 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 BTBD11A6QL63 1104 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAK2O60296 914 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 GCP02774 474 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 SLF2Q8IX21 1173 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-222ENST00000592408 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms