RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 HIP1O00291 1037 aa27.96■■■□□ 2.07
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EHD4-202ENST00000569223 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.96■■■□□ 2.07
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EHD4-202ENST00000569223 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP27.77■■■□□ 2.04
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