RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 NLRP10Q86W26 655 aa23.36■■□□□ 1.33
INO80E-211ENST00000567987 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.36■■□□□ 1.33
INO80E-211ENST00000567987 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
INO80E-211ENST00000567987 SMIM5Q71RC9 77 aa23.35■■□□□ 1.33
INO80E-211ENST00000567987 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
INO80E-211ENST00000567987 FOXO4P98177 505 aa23.34■■□□□ 1.33
INO80E-211ENST00000567987 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.34■■□□□ 1.33
INO80E-211ENST00000567987 LRRC4BQ9NT99 713 aa23.34■■□□□ 1.33
INO80E-211ENST00000567987 RPS6KA4O75676 772 aa23.33■■□□□ 1.33
INO80E-211ENST00000567987 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
INO80E-211ENST00000567987 FAM89AQ96GI7 184 aa23.33■■□□□ 1.33
INO80E-211ENST00000567987 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
INO80E-211ENST00000567987 GNPATO15228 680 aa23.33■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 RAB11FIP3O75154 756 aa23.33■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 C8orf34Q49A92 452 aa23.33■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.32■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa23.32■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.32■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.31■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 C4BP0C0L5 1744 aa23.31■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 SYNE4Q8N205 404 aa23.3■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.3■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.3■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 AMIGO3Q86WK7 504 aa23.29■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.29■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 BCORQ6W2J9 1755 aa23.29■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.29■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.29■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.28■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 SIL1Q9H173 461 aa23.28■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.28■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.27■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 SUSD4Q5VX71 490 aa23.27■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.27■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 AK7Q96M32 723 aa23.27■■□□□ 1.32
INO80E-211ENST00000567987 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP23.26■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.26■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 COPRSQ9NQ92 184 aa23.26■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 NARFQ9UHQ1 456 aa23.26■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 FAM177BA6PVY3 158 aa23.25■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 APBA3O96018 575 aa23.25■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 TXNRD1Q16881 649 aa23.25■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 PARP10Q53GL7 1025 aa23.25■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 BMP2KLQ5H9B9 411 aa23.25■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.25■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.25■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 PROM2Q8N271 834 aa23.25■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 PHF14O94880 888 aa23.24■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 SALL3Q9BXA9 1300 aa23.24■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 SCN7AQ01118 1682 aa23.24■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 ZPR1O75312 459 aa23.23■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 SASH1O94885 1247 aa23.23■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 BCL2L12Q9HB09 334 aa23.23■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 PDE1AP54750 535 aa23.23■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 PLSCR1O15162 318 aa23.22■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 TRAPPC3LQ5T215 181 aa23.22■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 TTC22Q5TAA0 569 aa23.22■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.22■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 RGL2O15211 777 aa23.21■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 CSF1RP07333 972 aa23.21■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 MX1P20591 662 aa23.21■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23.21■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 OSBPL3Q9H4L5 887 aa23.21■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
INO80E-211ENST00000567987 NTSR2O95665 410 aa23.2■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 RFC4P35249 363 aa23.2■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.2■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.2■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.2■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 PDE8AO60658 829 aa23.2■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 C4AP0C0L4 1744 aa23.2■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.2■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 UBR3Q6ZT12 1888 aa23.19■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 MYH3P11055 1940 aa23.19■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 CTSWP56202 376 aa23.19■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.19■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 STAP2Q9UGK3 403 aa23.18■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 ADRA2BP18089 450 aa23.17■■□□□ 1.3
INO80E-211ENST00000567987 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms