RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566635.5

HERC2-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HERC2, Length 2,114 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC2-208ENST00000566635 NLRP10Q86W26 655 aa21.97■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.97■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 AMIGO3Q86WK7 504 aa21.97■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 C4AP0C0L4 1744 aa21.96■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 SURF6O75683 361 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.11
HERC2-208ENST00000566635 RPS6KA4O75676 772 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 FAM89AQ96GI7 184 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 FOXO4P98177 505 aa21.94■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 SYNE4Q8N205 404 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 LRRCC1Q9C099 1032 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.92■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 LMBR1LQ6UX01 489 aa21.91■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 AK7Q96M32 723 aa21.91■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 SLC27A3Q5K4L6 730 aa21.91■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 PHF14O94880 888 aa21.89■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 TXNRD1Q16881 649 aa21.89■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 C8orf34Q49A92 452 aa21.89■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 PROM2Q8N271 834 aa21.89■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa21.89■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.89■■□□□ 1.1
HERC2-208ENST00000566635 RAB11FIP3O75154 756 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 APBA3O96018 575 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 SUSD4Q5VX71 490 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 BACH2Q9BYV9 841 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 SIL1Q9H173 461 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 CDHR2Q9BYE9 1310 aa21.89■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 FAM177BA6PVY3 158 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 FAM161AQ3B820 660 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 USPL1Q5W0Q7 1092 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 NARFQ9UHQ1 456 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 MYH3P11055 1940 aa21.88■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa21.87■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.87■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 PLA2G12BQ9BX93 195 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.86■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 LAMB2P55268 1798 aa21.86■■□□□ 1.09
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HERC2-208ENST00000566635 PARP10Q53GL7 1025 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 COPRSQ9NQ92 184 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 COL24A1Q17RW2 1714 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 PLSCR1O15162 318 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 NTSR2O95665 410 aa21.85■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 ZPR1O75312 459 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 TRAPPC3LQ5T215 181 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa21.84■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.83■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 SH3TC1Q8TE82 1336 aa21.83■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
HERC2-208ENST00000566635 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
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HERC2-208ENST00000566635 TSHZ3Q63HK5 1081 aa21.83■■□□□ 1.08
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HERC2-208ENST00000566635 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 RGL2O15211 777 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 RFC4P35249 363 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 CTSWP56202 376 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.82■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 CSF1RP07333 972 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 PDE1AP54750 535 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 BMP2KLQ5H9B9 411 aa21.81■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 MX1P20591 662 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 TTC22Q5TAA0 569 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 CASZ1Q86V15 1759 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 PDE8AO60658 829 aa21.8■■□□□ 1.08
HERC2-208ENST00000566635 ADRA2BP18089 450 aa21.8■■□□□ 1.08
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