RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564172.1

GDE1-203, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GDE1, Length 2,238 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-203ENST00000564172 CASP7P55210 303 aa21.82■■□□□ 1.08
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GDE1-203ENST00000564172 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
GDE1-203ENST00000564172 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.82■■□□□ 1.08
GDE1-203ENST00000564172 FAM161AQ3B820 660 aa21.81■■□□□ 1.08
GDE1-203ENST00000564172 FAM196AQ6ZSG2 479 aa21.81■■□□□ 1.08
GDE1-203ENST00000564172 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.81■■□□□ 1.08
GDE1-203ENST00000564172 ZNF831Q5JPB2 1677 aa21.81■■□□□ 1.08
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GDE1-203ENST00000564172 COL15A1P39059 1388 aa21.8■■□□□ 1.08
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GDE1-203ENST00000564172 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
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GDE1-203ENST00000564172 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
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GDE1-203ENST00000564172 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.72■■□□□ 1.07
GDE1-203ENST00000564172 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP21.72■■□□□ 1.07
GDE1-203ENST00000564172 RHPN1Q8TCX5 695 aa21.72■■□□□ 1.07
GDE1-203ENST00000564172 KIF1BPQ96EK5 621 aa21.72■■□□□ 1.07
GDE1-203ENST00000564172 EP400Q96L91 3159 aa21.72■■□□□ 1.07
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GDE1-203ENST00000564172 LY75O60449 1722 aa21.71■■□□□ 1.07
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GDE1-203ENST00000564172 COPRSQ9NQ92 184 aa21.68■■□□□ 1.06
GDE1-203ENST00000564172 SALL3Q9BXA9 1300 aa21.68■■□□□ 1.06
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GDE1-203ENST00000564172 SMIM5Q71RC9 77 aa21.67■■□□□ 1.06
GDE1-203ENST00000564172 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.67■■□□□ 1.06
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GDE1-203ENST00000564172 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
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GDE1-203ENST00000564172 NARFQ9UHQ1 456 aa21.63■■□□□ 1.05
GDE1-203ENST00000564172 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
GDE1-203ENST00000564172 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.63■■□□□ 1.05
GDE1-203ENST00000564172 SEC24BO95487 1268 aa21.62■■□□□ 1.05
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