RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558379.5

TLE3-213, Transcript of transducin like enhancer of split 3, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TLE3, Length 2,304 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TLE3-213	ENST00000558379	NUTM2B	A6NNL0	878 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	NUTM2E	B1AL46	878 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	NUTM2A	Q8IVF1	878 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	NEK4	P51957	841 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		15.23	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	MCM4	P33991	863 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	GSE1	Q14687	1217 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		15.22	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	SPATA31A1	Q5TZJ5	1347 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	VSIG10	Q8N0Z9	540 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	SYNE4	Q8N205	404 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	ARX	Q96QS3	562 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	NRAP	Q86VF7	1730 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	RAD50	Q92878	1312 aa		15.21	■□□□□ 0.03
TLE3-213	ENST00000558379	HSPA4	P34932	840 aa		15.21	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	PKP1	Q13835	747 aa		15.21	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	HLF	Q16534	295 aa		15.21	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	TNNI3K	Q59H18	835 aa		15.21	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		15.21	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	RASEF	Q8IZ41	740 aa		15.21	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	FAM227B	Q96M60	508 aa		15.21	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		15.21	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	ST18	O60284	1047 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	CHGB	P05060	677 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	15.2	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	PTH1R	Q03431	593 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	TCIRG1	Q13488	830 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	GPATCH3	Q96I76	525 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		15.2	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	STARD3NL	O95772	234 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	SSFA2	P28290	1259 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	LRRC24	Q50LG9	513 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	EVI5L	Q96CN4	794 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	FAM89A	Q96GI7	184 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		15.19	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	15.19	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	ANAPC15	P60006	121 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	IL17RA	Q96F46	866 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	ACSBG1	Q96GR2	724 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	LRP6	O75581	1613 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	TMX3	Q96JJ7	454 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	15.18	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		15.18	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	MCC	P23508	829 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	GPT	P24298	496 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379		A0A0D9SFI3	127 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379		A0A0G2JS52	829 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	NMI	Q13287	307 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	15.17	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	DDB1	Q16531	1140 aa		15.17	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	TIMM10	P62072	90 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	CPA1	P15085	419 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		15.16	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	EP400	Q96L91	3159 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	ATP5J	P18859	108 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	LARP6	Q9BRS8	491 aa	Known RBP	15.15	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	FSD1	Q9BTV5	496 aa		15.15	■□□□□ 0.02
TLE3-213	ENST00000558379	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	15.14	■□□□□ 0.01
TLE3-213	ENST00000558379	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TLE3-213	ENST00000558379	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TLE3-213	ENST00000558379	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	15.14	■□□□□ 0.01
TLE3-213	ENST00000558379	NUP98	P52948	1817 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TLE3-213	ENST00000558379	KCNQ2	O43526	872 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TLE3-213	ENST00000558379	NLRP10	Q86W26	655 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TLE3-213	ENST00000558379	ZDHHC9	Q9Y397	364 aa		15.14	■□□□□ 0.01
TLE3-213	ENST00000558379	SLIT2	O94813	1529 aa		15.13	■□□□□ 0.01
TLE3-213	ENST00000558379	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
TLE3-213	ENST00000558379	EYA2	O00167	538 aa		15.13	■□□□□ 0.01
TLE3-213	ENST00000558379	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	15.13	■□□□□ 0.01
TLE3-213	ENST00000558379	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		15.13	■□□□□ 0.01
TLE3-213	ENST00000558379	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01
TLE3-213	ENST00000558379	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		15.13	■□□□□ 0.01
TLE3-213	ENST00000558379	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		15.13	■□□□□ 0.01
TLE3-213	ENST00000558379	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	15.13	■□□□□ 0.01

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.8 ms