RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552947.1

ATG101-206, Transcript of autophagy related 101, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG101, Length 1,312 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG101-206ENST00000552947 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.24■■□□□ 1.15
ATG101-206ENST00000552947 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG101-206ENST00000552947 NUP98P52948 1817 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG101-206ENST00000552947 ALDH1L1O75891 902 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG101-206ENST00000552947 MMP10P09238 476 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG101-206ENST00000552947 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
ATG101-206ENST00000552947 NLRP10Q86W26 655 aa22.23■■□□□ 1.15
ATG101-206ENST00000552947 KLHL34Q8N239 644 aa22.23■■□□□ 1.15
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ATG101-206ENST00000552947 PDE3AQ14432 1141 aa22.22■■□□□ 1.15
ATG101-206ENST00000552947 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.22■■□□□ 1.15
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ATG101-206ENST00000552947 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
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ATG101-206ENST00000552947 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.07■■□□□ 1.12
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ATG101-206ENST00000552947 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
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ATG101-206ENST00000552947 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP22.06■■□□□ 1.12
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ATG101-206ENST00000552947 NLRP3Q96P20 1036 aa22.05■■□□□ 1.12
ATG101-206ENST00000552947 GNAI2P04899 355 aa22.04■■□□□ 1.12
ATG101-206ENST00000552947 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
ATG101-206ENST00000552947 NEFLP07196 543 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG101-206ENST00000552947 PDE6BP35913 854 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG101-206ENST00000552947 CTSWP56202 376 aa22.03■■□□□ 1.12
ATG101-206ENST00000552947 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
ATG101-206ENST00000552947 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.02■■□□□ 1.12
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ATG101-206ENST00000552947 KAZALD1Q96I82 304 aa22.02■■□□□ 1.12
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