RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551676.5

PPP1CC-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene PPP1CC, Length 1,581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PPP1CC-208	ENST00000551676	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
PPP1CC-208	ENST00000551676	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		31.83	■■■□□ 2.69
PPP1CC-208	ENST00000551676	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		31.82	■■■□□ 2.69
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		31.82	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	RFX5	P48382	616 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	NUP98	P52948	1817 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	RXRB	P28702	533 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	OSBPL3	Q9H4L5	887 aa		31.81	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		31.8	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	31.8	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	RGL2	O15211	777 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	RPS6KA4	O75676	772 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	GPT	P24298	496 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	COPRS	Q9NQ92	184 aa		31.79	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		31.78	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	TTC22	Q5TAA0	569 aa		31.77	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	RGS17	Q9UGC6	210 aa	Predicted RBP	31.77	■■■□□ 2.68
PPP1CC-208	ENST00000551676	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	FAM89A	Q96GI7	184 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	STAP2	Q9UGK3	403 aa		31.76	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	PDE1A	P54750	535 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	PTPN12	Q05209	780 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	31.75	■■■□□ 2.67	2e-7	■□□□□ 8.3
PPP1CC-208	ENST00000551676	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	31.75	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		31.75	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		31.74	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRIM37	O94972	964 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	PARP10	Q53GL7	1025 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		31.73	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	MX1	P20591	662 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	BCL11A	Q9H165	835 aa		31.72	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	AOX1	Q06278	1338 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	SASH1	O94885	1247 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	CSF1R	P07333	972 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		31.71	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		31.7	■■■□□ 2.67
PPP1CC-208	ENST00000551676	GNPAT	O15228	680 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	C4B	P0C0L5	1744 aa		31.69	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	SUSD4	Q5VX71	490 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	NARF	Q9UHQ1	456 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	SYNE4	Q8N205	404 aa		31.68	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	SEC24B	O95487	1268 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	POTEA	Q6S8J7	498 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	AK7	Q96M32	723 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	SIL1	Q9H173	461 aa		31.67	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	31.66	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		31.66	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	SCN7A	Q01118	1682 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		31.65	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		31.64	■■■□□ 2.66
PPP1CC-208	ENST00000551676	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	PDE8A	O60658	829 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	NTSR2	O95665	410 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	SMIM5	Q71RC9	77 aa		31.63	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	SDS	P20132	328 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	CTSW	P56202	376 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	AMIGO3	Q86WK7	504 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		31.62	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	PLSCR1	O15162	318 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	CIAO1	O76071	339 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	ADRA2B	P18089	450 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	CCDC57	Q2TAC2	916 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	FBXO3	Q9UK99	471 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	CDC45	O75419	566 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	PROM2	Q8N271	834 aa		31.6	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	ZPR1	O75312	459 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	31.59	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	TRAPPC3L	Q5T215	181 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	AACS	Q86V21	672 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		31.59	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	31.59	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	EYA2	O00167	538 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	31.58	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	TXNRD1	Q16881	649 aa		31.58	■■■□□ 2.65
PPP1CC-208	ENST00000551676	TFCP2	Q12800	502 aa		31.57	■■■□□ 2.64

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