RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, human

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STIP1-208	ENST00000540501	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
STIP1-208	ENST00000540501	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		32.41	■■■□□ 2.78
STIP1-208	ENST00000540501	GCKR	Q14397	625 aa		32.4	■■■□□ 2.78
STIP1-208	ENST00000540501	MTFR1L	Q9H019	292 aa		32.4	■■■□□ 2.78
STIP1-208	ENST00000540501	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		32.39	■■■□□ 2.78
STIP1-208	ENST00000540501	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
STIP1-208	ENST00000540501	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	32.38	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		32.37	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		32.37	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		32.37	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		32.37	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	COG6	Q9Y2V7	657 aa		32.37	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	NEFL	P07196	543 aa		32.36	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	GNAI3	P08754	354 aa		32.36	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		32.36	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	GRM8	O00222	908 aa		32.35	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	SUSD4	Q5VX71	490 aa		32.35	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	32.35	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	AAMP	Q13685	434 aa		32.34	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	UTY	O14607	1347 aa		32.33	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501		H7C1W4	665 aa		32.33	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	MMP10	P09238	476 aa		32.33	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	MSL1	Q68DK7	614 aa		32.33	■■■□□ 2.77
STIP1-208	ENST00000540501	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		32.32	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	SERPINB2	P05120	415 aa		32.32	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	POLD1	P28340	1107 aa		32.32	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	USP44	Q9H0E7	712 aa		32.32	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	NPHP1	O15259	732 aa		32.31	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	NTSR2	O95665	410 aa		32.31	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		32.3	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	UBTFL1	P0CB47	393 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	ZBTB7A	O95365	584 aa		32.29	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	DDR1	Q08345	913 aa		32.29	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	CNBD1	Q8NA66	436 aa		32.29	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	FAM177B	A6PVY3	158 aa		32.28	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	ST5	P78524	1137 aa		32.28	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	CRBN	Q96SW2	442 aa		32.28	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		32.27	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		32.27	■■■□□ 2.76
STIP1-208	ENST00000540501	SLC10A5	Q5PT55	438 aa		32.26	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	FAM89A	Q96GI7	184 aa		32.26	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	MEIS3	Q99687	375 aa		32.26	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	CASP7	P55210	303 aa		32.25	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	GNAI2	P04899	355 aa		32.24	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		32.24	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	SPON1	Q9HCB6	807 aa		32.24	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	32.23	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		32.23	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		32.23	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		32.23	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	PDE8A	O60658	829 aa		32.21	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	ERFE	Q4G0M1	354 aa		32.21	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		32.21	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	MYH3	P11055	1940 aa		32.2	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	LAMB2	P55268	1798 aa		32.2	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.75
STIP1-208	ENST00000540501	NLRP3	Q96P20	1036 aa		32.19	■■■□□ 2.74
STIP1-208	ENST00000540501	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		32.19	■■■□□ 2.74
STIP1-208	ENST00000540501	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	32.18	■■■□□ 2.74
STIP1-208	ENST00000540501	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		32.18	■■■□□ 2.74
STIP1-208	ENST00000540501	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		32.18	■■■□□ 2.74
STIP1-208	ENST00000540501	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		32.17	■■■□□ 2.74
STIP1-208	ENST00000540501	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	32.17	■■■□□ 2.74
STIP1-208	ENST00000540501	SUCLG2	Q96I99	432 aa		32.17	■■■□□ 2.74
STIP1-208	ENST00000540501	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		32.17	■■■□□ 2.74
STIP1-208	ENST00000540501	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	32.16	■■■□□ 2.74
STIP1-208	ENST00000540501	DDX60	Q8IY21	1712 aa	Known RBP	32.15	■■■□□ 2.74
STIP1-208	ENST00000540501	SYNE4	Q8N205	404 aa		32.15	■■■□□ 2.74
STIP1-208	ENST00000540501	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
STIP1-208	ENST00000540501	PDE6B	P35913	854 aa		32.14	■■■□□ 2.74
STIP1-208	ENST00000540501	ABCC12	Q96J65	1359 aa		32.14	■■■□□ 2.74
STIP1-208	ENST00000540501	PTGER2	P43116	358 aa		32.13	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	32.13	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	RABL6	Q3YEC7	729 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	CTSW	P56202	376 aa		32.12	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		32.12	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	CSF1R	P07333	972 aa		32.11	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	FOXO4	P98177	505 aa		32.11	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	KAZALD1	Q96I82	304 aa		32.11	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	32.11	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	32.1	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	MTX1	Q13505	466 aa		32.1	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		32.09	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		32.09	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		32.08	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		32.08	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		32.08	■■■□□ 2.73
STIP1-208	ENST00000540501	RTL9	Q8NET4	1388 aa		32.07	■■■□□ 2.73

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.5 ms