RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 LNPKQ9C0E8 428 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 KIAA0754O94854 1291 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 TTC22Q5TAA0 569 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 DNAAF4Q8WXU2 420 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 GOLGA6L10A6NI86 522 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 DMTNQ08495 405 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 HYPKQ9NX55 129 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 TATP17735 454 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 ATP8B2P98198 1209 aa7.12□□□□□ -1.27
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PTPRD-214ENST00000540109 ERBB4Q15303 1308 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 NUTM1Q86Y26 1132 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 MRC1P22897 1456 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM94Q12767 1356 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 IL17REQ8NFR9 667 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
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PTPRD-214ENST00000540109 MICALCLQ6ZW33 695 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 KRT222Q8N1A0 295 aa7.12□□□□□ -1.27
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PTPRD-214ENST00000540109 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 LRRCC1Q9C099 1032 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 KIAA1328Q86T90 577 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 RUFY1Q96T51 708 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 ERBB3P21860 1342 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 MYO6Q9UM54 1294 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 SYCE3A1L190 88 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 BTBD11A6QL63 1104 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 LMAN1P49257 510 aa7.11□□□□□ -1.27
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PTPRD-214ENST00000540109 CCDC91Q7Z6B0 441 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 GPATCH3Q96I76 525 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 NBPF4Q96M43 638 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 HEG1Q9ULI3 1381 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 NEXNQ0ZGT2 675 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 PKD1L3Q7Z443 1732 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 RSPH14Q9UHP6 348 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
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PTPRD-214ENST00000540109 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
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PTPRD-214ENST00000540109 FOXO3O43524 673 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 STAP2Q9UGK3 403 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 IFNL2Q8IZJ0 200 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 PDCP20941 246 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 ANAPC15P60006 121 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 MTX1Q13505 466 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 IQCEQ6IPM2 695 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC102AQ96A19 550 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 NF2P35240 595 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 SSH3Q8TE77 659 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 DCAF5Q96JK2 942 aa7.09□□□□□ -1.27
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PTPRD-214ENST00000540109 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 ERC2O15083 957 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-214ENST00000540109 TTC41PQ6P2S7 1318 aa7.09□□□□□ -1.28
PTPRD-214ENST00000540109 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-214ENST00000540109 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-214ENST00000540109 ORAI2Q96SN7 254 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-214ENST00000540109 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-214ENST00000540109 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
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