RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 WHAMMQ8TF30 809 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRERF1Q96PN7 1200 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLC30A3Q99726 388 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGF1RP08069 1367 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 GDF11O95390 407 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM157BP0CG42 384 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 MX2P20592 715 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 INPP5BP32019 993 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 ECM1Q16610 540 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 SAMD5Q5TGI4 173 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 RGL4Q8IZJ4 473 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 HELQQ8TDG4 1101 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRAIPQ9BWF2 469 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 CFHR5Q9BXR6 569 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 STIM2Q9P246 746 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 KLF15Q9UIH9 416 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADAMTS2O95450 1211 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 BRD1O95696 1058 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 BMP4P12644 408 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 BRD2P25440 801 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZAP70P43403 619 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 LCE1DQ5T752 114 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRT25Q7Z3Z0 450 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 AEBP1Q8IUX7 1158 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 GPR152Q8TDT2 470 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 MBIPQ9NS73 344 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 MARK1Q9P0L2 795 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 A6NHS1 94 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 H3BRB1 525 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 IER5Q5VY09 327 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 LYPD4Q6UWN0 246 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 ACDQ96AP0 544 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 PHF24Q9UPV7 400 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNH4Q9UQ05 1017 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 NEURL1BA8MQ27 555 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 ICMTO60725 284 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 SASH3O75995 380 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 SLURP2P0DP57 97 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 TARSP26639 723 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARSDP51689 593 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNQ4P56696 695 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDE4CQ08493 712 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 SPEM2Q0P670 501 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 HIF1AQ16665 826 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 SYT9Q86SS6 491 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 BHMTQ93088 406 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 GSX2Q9BZM3 304 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCDC87Q9NVE4 849 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 GGA1Q9UJY5 639 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 KCNMB2Q9Y691 235 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU6-344P-201ENST00000516635 SOWAHDA6NJG2 315 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 FZD6O60353 706 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 GSK3AP49840 483 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 ARHGAP4P98171 946 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM182BQ5T319 152 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 FCHSD1Q86WN1 690 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 GLYCTKQ8IVS8 523 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 EDEM1Q92611 657 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 GGNBP2Q9H3C7 697 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZFATQ9P243 1243 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 PRR12Q9ULL5 1215 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 POLIQ9UNA4 740 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 SHISA8B8ZZ34 492 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 XYLBO75191 536 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDGFAP04085 211 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 NPR3P17342 541 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 NFKB1P19838 968 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 AAMPQ13685 434 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 LAMC2Q13753 1193 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 HOMEZQ8IX15 550 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 ABTB2Q8N961 1025 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 IGFLR1Q9H665 355 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU6-344P-201ENST00000516635 EGFL7Q9UHF1 273 aa4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms