RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa10.44□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 CYP2U1Q7Z449 544 aa10.44□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 SLAIN2Q9P270 581 aa10.44□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 FAM135BQ49AJ0 1406 aa10.43□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 ATP2B4P23634 1241 aa10.43□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 NNTQ13423 1086 aa10.43□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 C1orf216Q8TAB5 229 aa10.43□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 PIK3C2BO00750 1634 aa10.43□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa10.42□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 BACH1O14867 736 aa10.42□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 GDF9O60383 454 aa10.42□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 GNRH1P01148 92 aa10.42□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP10.42□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa10.42□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 TMEM229AB2RXF0 380 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP10.41□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 LTKP29376 864 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 SCNN1DP51172 638 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 HINFPQ9BQA5 517 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 ZNF358Q9NW07 568 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa10.41□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 LRP6O75581 1613 aa10.4□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 GDF10P55107 478 aa10.4□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 ESCO1Q5FWF5 840 aa10.4□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 TXNDC2Q86VQ3 553 aa10.4□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 CYP4X1Q8N118 509 aa10.4□□□□□ -0.74
HERC3-210ENST00000512194 MYO5BQ9ULV0 1848 aa10.4□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 NWD1Q149M9 1564 aa10.39□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 INHAP05111 366 aa10.39□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 ADD1P35611 737 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 OCLNQ16625 522 aa10.39□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 TET3O43151 1660 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 PRR20EP86478 221 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 PRR20CP86479 221 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 PRR20DP86480 221 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 PRR20BP86481 221 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 PRR20AP86496 221 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP10.38□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 TOR4AQ9NXH8 423 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 TMEM94Q12767 1356 aa10.38□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 PRMT3O60678 531 aa10.37□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 WEE1P30291 646 aa10.37□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 NEUROD1Q13562 356 aa10.37□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 SLC4A9Q96Q91 983 aa10.37□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 ETNK1Q9HBU6 452 aa10.37□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 UNC13BO14795 1591 aa10.36□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 J3QL48 77 aa10.36□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 ADH1AP07327 375 aa10.36□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 TMCO4Q5TGY1 634 aa10.36□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZVU0 165 aa10.36□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 TAS1R3Q7RTX0 852 aa10.36□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 PRIMPOLQ96LW4 560 aa10.36□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 MTMR7Q9Y216 660 aa10.36□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 SHPRHQ149N8 1683 aa10.36□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 GAS2L2Q8NHY3 880 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 XAGE2Q96GT9 111 aa10.35□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 TNFRSF10AO00220 468 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 RGS20O76081 388 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 IGFBP4P22692 258 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 ITPKCQ96DU7 683 aa10.34□□□□□ -0.75
HERC3-210ENST00000512194 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10.33□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 STAU1O95793 577 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 SMPD1P17405 629 aa10.33□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 EPHA4P54764 986 aa10.33□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 WDR4P57081 412 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa10.33□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 TONSLQ96HA7 1378 aa10.33□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa10.33□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 DIP2AQ14689 1571 aa10.32□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 FOXO3O43524 673 aa10.32□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 SMTNP53814 917 aa10.32□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 TRIM67Q6ZTA4 783 aa10.32□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP10.32□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 TNS4Q8IZW8 715 aa10.32□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 SIN3AQ96ST3 1273 aa10.32□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa10.32□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 SERTAD1Q9UHV2 236 aa10.32□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 EFCAB6Q5THR3 1501 aa10.32□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 JCADQ9P266 1359 aa10.31□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 TMEM2Q9UHN6 1383 aa10.31□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 TIMP2P16035 220 aa10.31□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 PTGIRP43119 386 aa10.31□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 CBLBQ13191 982 aa10.31□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 CLN3Q13286 438 aa10.31□□□□□ -0.76
HERC3-210ENST00000512194 MTFR1Q15390 333 aa10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms