RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491569.5

ATP6AP1-209, Transcript of ATPase H+ transporting accessory protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene ATP6AP1, Length 2,079 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1-209ENST00000491569 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.47■■□□□ 1.67
ATP6AP1-209ENST00000491569 COL15A1P39059 1388 aa25.47■■□□□ 1.67
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF831Q5JPB2 1677 aa25.47■■□□□ 1.67
ATP6AP1-209ENST00000491569 FOXO4P98177 505 aa25.46■■□□□ 1.67
ATP6AP1-209ENST00000491569 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.46■■□□□ 1.67
ATP6AP1-209ENST00000491569 SYNE4Q8N205 404 aa25.46■■□□□ 1.67
ATP6AP1-209ENST00000491569 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
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ATP6AP1-209ENST00000491569 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 RAB11FIP3O75154 756 aa25.44■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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ATP6AP1-209ENST00000491569 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.44■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 SIL1Q9H173 461 aa25.44■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.44■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.44■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.43■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 GNPATO15228 680 aa25.43■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.43■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 NUP98P52948 1817 aa25.42■■□□□ 1.66
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ATP6AP1-209ENST00000491569 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.42■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.41■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 LY75O60449 1722 aa25.41■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.41■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.41■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 FAM177BA6PVY3 158 aa25.4■■□□□ 1.66
ATP6AP1-209ENST00000491569 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
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ATP6AP1-209ENST00000491569 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
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ATP6AP1-209ENST00000491569 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.38■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 SEC24BO95487 1268 aa25.38■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 PDE1AP54750 535 aa25.38■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 SUSD4Q5VX71 490 aa25.38■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 SALL3Q9BXA9 1300 aa25.37■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa25.37■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 SASH1O94885 1247 aa25.36■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 TTC22Q5TAA0 569 aa25.36■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 COPRSQ9NQ92 184 aa25.36■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
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ATP6AP1-209ENST00000491569 PHF14O94880 888 aa25.35■■□□□ 1.65
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ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.34■■□□□ 1.65
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ATP6AP1-209ENST00000491569 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.33■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 PROM2Q8N271 834 aa25.33■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.33■■□□□ 1.65
ATP6AP1-209ENST00000491569 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.33■■□□□ 1.65
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ATP6AP1-209ENST00000491569 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.32■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.32■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
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ATP6AP1-209ENST00000491569 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 PARP10Q53GL7 1025 aa25.31■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.31■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 ZPR1O75312 459 aa25.3■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 APBA3O96018 575 aa25.3■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 CSF1RP07333 972 aa25.3■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 TXNRD1Q16881 649 aa25.3■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.3■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 STAP2Q9UGK3 403 aa25.3■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.29■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 CTSWP56202 376 aa25.29■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.29■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 AACSQ86V21 672 aa25.29■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.29■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 BCORQ6W2J9 1755 aa25.29■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 NTSR2O95665 410 aa25.28■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 SDSP20132 328 aa25.28■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.28■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 PDE8AO60658 829 aa25.28■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 TFCP2Q12800 502 aa25.28■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 GREM2Q9H772 168 aa25.28■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 LRRC24Q50LG9 513 aa25.27■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 RFC4P35249 363 aa25.27■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 ATG9AQ7Z3C6 839 aa25.27■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
ATP6AP1-209ENST00000491569 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
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