RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	ABCA6	Q8N139	1617 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	CPLX1	O14810	134 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	11.51	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	BMS1	Q14692	1282 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	ANKRD1	Q15327	319 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	CFAP100	Q494V2	611 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	VPS53	Q5VIR6	699 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	SYNE3	Q6ZMZ3	975 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	11.51	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	ASXL2	Q76L83	1435 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	ANO10	Q9NW15	660 aa		11.51	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	NPAT	Q14207	1427 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	GABPB1	Q06547	395 aa	Predicted RBP	11.5	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	STX1A	Q16623	288 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	NEK11	Q8NG66	645 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	MYL6B	P14649	208 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	11.5	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	IFNK	Q9P0W0	207 aa		11.5	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	MYOM1	P52179	1685 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	ABCC1	P33527	1531 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	KMT5B	Q4FZB7	885 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	11.49	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1B0GVL5	298 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	LMAN1	P49257	510 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292		Q6ZUG5	572 aa		11.49	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	11.49	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	EVI5L	Q96CN4	794 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	11.48	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	11.48	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	ACE	P12821	1306 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	PIK3R4	Q99570	1358 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	ZFYVE9	O95405	1425 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	MYOM2	P54296	1465 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	TERF2	Q15554	542 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	ANKRD7	Q92527	254 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	ERO1A	Q96HE7	468 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP3K19	Q56UN5	1328 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP10D	Q9P241	1426 aa		11.48	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC27A2	O14975	620 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	EYA1	Q99502	592 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP7A	Q04656	1500 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	PES1	O00541	588 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	11.47	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	NEK1	Q96PY6	1258 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	GOLGA8F	Q08AF8	430 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	GOLGA8DP	Q0D2H9	430 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	TOMM22	Q9NS69	142 aa		11.47	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	WASHC4	Q2M389	1173 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	ABTB2	Q8N961	1025 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	MED14	O60244	1454 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	APOBR	Q0VD83	1088 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	CARD6	Q9BX69	1037 aa		11.46	□□□□□ -0.57
ERCC3-208	ENST00000491292	HIP1	O00291	1037 aa		11.46	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	GNG11	P61952	73 aa		11.46	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		11.46	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	MCM6	Q14566	821 aa		11.46	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	CPLX3	Q8WVH0	158 aa		11.46	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.46	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		11.46	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	NEMF	O60524	1076 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	HAND2	P61296	217 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	TTC14	Q96N46	770 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	STAP2	Q9UGK3	403 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A0D9SFI3	127 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	BTBD11	A6QL63	1104 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	PHACTR2	O75167	634 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	KRBA2	Q6ZNG9	492 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF216	Q9NWF9	866 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
ERCC3-208	ENST00000491292	HDAC5	Q9UQL6	1122 aa		11.45	□□□□□ -0.58

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