RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.31■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 MCM4P33991 863 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 COPRSQ9NQ92 184 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 PALLDQ8WX93 1383 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 SIK1P57059 783 aa23.29■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 RREB1Q92766 1687 aa23.28■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 ZNF831Q5JPB2 1677 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 ATP6V1AP38606 617 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 FOXO4P98177 505 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 RABEP1Q15276 862 aa23.27■■□□□ 1.32
SYF2-204ENST00000476231 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 SASH1O94885 1247 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 USP26Q9BXU7 913 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa23.26■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 KCNQ2O43526 872 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 ARXQ96QS3 562 aa23.25■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 PI4K2BQ8TCG2 481 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 AFF2P51816 1311 aa23.24■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 EIF5P55010 431 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 GPATCH3Q96I76 525 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 SIL1Q9H173 461 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 REC8O95072 547 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 HLFQ16534 295 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.23■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 ITPK1Q13572 414 aa23.22■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 ERC2O15083 957 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 ATRNO75882 1429 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 NUP98P52948 1817 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 AACSQ86V21 672 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 RILPL2Q969X0 211 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.21■■□□□ 1.31
SYF2-204ENST00000476231 NLRP10Q86W26 655 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 PLA2G12BQ9BX93 195 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 NHSQ6T4R5 1651 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 PTMSP20962 102 aa23.2■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.19■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 AK9Q5TCS8 1911 aa23.18■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 CHMLP26374 656 aa23.17■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 CNTROBQ8N137 903 aa23.17■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 GPTP24298 496 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 FAM89AQ96GI7 184 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 IL27Q8NEV9 243 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 GBP4Q96PP9 640 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 BTAF1O14981 1849 aa23.16■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.15■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 CLEC17AQ6ZS10 378 aa23.14■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
SYF2-204ENST00000476231 CSF1RP07333 972 aa23.14■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 TFCP2Q12800 502 aa23.14■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 CIAO1O76071 339 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 TNNI3KQ59H18 835 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.13■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 TRAK2O60296 914 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 IL15P40933 162 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 FBXO3Q9UK99 471 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 CAMTA2O94983 1202 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.12■■□□□ 1.29
SYF2-204ENST00000476231 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.7 ms