RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000448490.1

LINC00865-201, long intergenic non-protein coding RNA 865, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LINC00865, Length 3,891 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00865-201ENST00000448490 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 SASH1O94885 1247 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 FOSBP53539 338 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 TAF7LQ5H9L4 462 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 LMBR1LQ6UX01 489 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 TFCP2Q12800 502 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 FERMT3Q86UX7 667 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 A1BGP04217 495 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 RNF20Q5VTR2 975 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 GPT2Q8TD30 523 aa14.52□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LINC00865-201ENST00000448490 NFAT5O94916 1531 aa14.52□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 PDIA6Q15084 440 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 A0A0D9SFI3 127 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 MBD3O95983 291 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 GJB2P29033 226 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 RGPD2P0DJD1 1756 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.51□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 HIP1O00291 1037 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 KAZALD1Q96I82 304 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 PPFIA3O75145 1194 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 TTLL7Q6ZT98 887 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 RUFY3Q7L099 469 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 STX6O43752 255 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 BRD1O95696 1058 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 CREB3L3Q68CJ9 461 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 USP48Q86UV5 1035 aa14.5□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 PHF14O94880 888 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 LARGE1O95461 756 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 MTX1Q13505 466 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 PSMA5P28066 241 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 LRRC2Q9BYS8 371 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 RBSNQ9H1K0 784 aa14.49□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 NCAPD2Q15021 1401 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 GOLIM4O00461 696 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 SYT1P21579 422 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 TIMM10P62072 90 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 ZNF592Q92610 1267 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 CHGBP05060 677 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 CUL4AQ13619 759 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 FBXW7Q969H0 707 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 FAM177BA6PVY3 158 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 SNRKQ9NRH2 765 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa14.48□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 TNNI3KQ59H18 835 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 GPTP24298 496 aa14.47□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 DDX11Q96FC9 970 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 TMOD3Q9NYL9 352 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 MEGF6O75095 1541 aa14.46□□□□□ -0.09
LINC00865-201ENST00000448490 WASHC4Q2M389 1173 aa14.46□□□□□ -0.1
LINC00865-201ENST00000448490 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
LINC00865-201ENST00000448490 SLC27A2O14975 620 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00865-201ENST00000448490 FAM173BQ6P4H8 233 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00865-201ENST00000448490 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00865-201ENST00000448490 TSPY26PQ9H489 355 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00865-201ENST00000448490 IL2RBP14784 551 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00865-201ENST00000448490 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
LINC00865-201ENST00000448490 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
LINC00865-201ENST00000448490 SLFNL1Q499Z3 407 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00865-201ENST00000448490 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
LINC00865-201ENST00000448490 H3BQV1 296 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00865-201ENST00000448490 IFFO2Q5TF58 517 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00865-201ENST00000448490 BRINP3Q76B58 766 aa14.45□□□□□ -0.1
LINC00865-201ENST00000448490 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms