RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441455.1

RPSAP20-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 20, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP20, Length 890 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP20-201ENST00000441455 AMIGO3Q86WK7 504 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 ZNF34Q8IZ26 560 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 PROM2Q8N271 834 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 KAZALD1Q96I82 304 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 DCTPP1Q9H773 170 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 LAMB2P55268 1798 aa13.14□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 UBN2Q6ZU65 1347 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 FAM177BA6PVY3 158 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 APBB1O00213 710 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 POLA2Q14181 598 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 EPHA10Q5JZY3 1008 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 ANKRD45Q5TZF3 282 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 USPL1Q5W0Q7 1092 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 SSH3Q8TE77 659 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 NARFQ9UHQ1 456 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP13.13□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 MYH3P11055 1940 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 COL24A1Q17RW2 1714 aa13.13□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 ZPR1O75312 459 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 RFC4P35249 363 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 NUCB1Q02818 461 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 MTX1Q13505 466 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 TRAPPC3LQ5T215 181 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 FAM89AQ96GI7 184 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 LNPKQ9C0E8 428 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 BCL11AQ9H165 835 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 CASZ1Q86V15 1759 aa13.12□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 SUSD4Q5VX71 490 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 BICDL1Q6ZP65 573 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 CHD1LQ86WJ1 897 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 BCL2L12Q9HB09 334 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 CHMP3Q9Y3E7 222 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 CDHR2Q9BYE9 1310 aa13.11□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 SURF6O75683 361 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 ADRA2BP18089 450 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 SSFA2P28290 1259 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 FOXO4P98177 505 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 ZNF827Q17R98 1081 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 PARP10Q53GL7 1025 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 TBC1D9BQ66K14 1250 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 LMBR1LQ6UX01 489 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 CLEC4GQ6UXB4 293 aa13.1□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 RGL2O15211 777 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 PDE4AP27815 886 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 SYNE4Q8N205 404 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 SH3TC1Q8TE82 1336 aa13.09□□□□□ -0.31
RPSAP20-201ENST00000441455 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 NTSR2O95665 410 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 BAG6P46379 1132 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 AKT1S1Q96B36 256 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 KLHDC4Q8TBB5 520 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 PLA2G12BQ9BX93 195 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 LRRCC1Q9C099 1032 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 QSER1Q2KHR3 1735 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 MSH5O43196 834 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 PDE8AO60658 829 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 RAB11FIP3O75154 756 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 NUTM1Q86Y26 1132 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 CAMKK2Q96RR4 588 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 SETDB2Q96T68 719 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 SIL1Q9H173 461 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 SPEF2Q9C093 1822 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 CTSWP56202 376 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 FAM161AQ3B820 660 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 DEFB132Q7Z7B7 95 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 RHPN1Q8TCX5 695 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 KIF1BPQ96EK5 621 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 GYS1P13807 737 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 CCDC57Q2TAC2 916 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 ERFEQ4G0M1 354 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP20-201ENST00000441455 ERC1Q8IUD2 1116 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms