RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.29■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 COL15A1P39059 1388 aa28.29■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 LRP6O75581 1613 aa28.29■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 TJP1Q07157 1748 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 DOT1LQ8TEK3 1739 aa28.28■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 KIF6Q6ZMV9 814 aa28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 FOXD4L1Q9NU39 408 aa28.27■■■□□ 2.12
FAAP20-209ENST00000428120 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP28.26■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 TFCP2Q12800 502 aa28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 TCIRG1Q13488 830 aa28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa28.25■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 MYT1Q01538 1121 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 PALD1Q9ULE6 856 aa28.24■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 SLIT2O94813 1529 aa28.23■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 HLFQ16534 295 aa28.22■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 C8orf37Q96NL8 207 aa28.22■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 CHMP5Q9NZZ3 219 aa28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 BOLA2Q9H3K6 86 aa28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa28.21■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 SGSM2O43147 1006 aa28.2■■■□□ 2.11
FAAP20-209ENST00000428120 GPTP24298 496 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 TNNI3KQ59H18 835 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 FAM89AQ96GI7 184 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa28.2■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 MCCP23508 829 aa28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.19■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 NGLY1Q96IV0 654 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 EVI5LQ96CN4 794 aa28.18■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 DDIT3P35638 169 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 BARGINQ6ZT62 677 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 ST18O60284 1047 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 SYNE4Q8N205 404 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa28.17■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 ATG9AQ7Z3C6 839 aa28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 NEK4P51957 841 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 DBNDD2Q9BQY9 259 aa28.14■■■□□ 2.1
FAAP20-209ENST00000428120 KCNQ2O43526 872 aa28.14■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6V1AP38606 617 aa28.14■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC24Q50LG9 513 aa28.14■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 DEKP35659 375 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 RAD50Q92878 1312 aa28.13■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 NLRP10Q86W26 655 aa28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 FAM227BQ96M60 508 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 BCL9LQ86UU0 1499 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 JCADQ9P266 1359 aa28.11■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 HSPA4P34932 840 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 SIK1P57059 783 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 ANAPC15P60006 121 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 FSD1Q9BTV5 496 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 NEUROD6Q96NK8 337 aa28.1■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 EYA2O00167 538 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC57Q2TAC2 916 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 RUFY2Q8WXA3 655 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 IL15P40933 162 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 ITPK1Q13572 414 aa28.09■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 TIMM10P62072 90 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 ATP5JP18859 108 aa28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 CRKLP46109 303 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
FAAP20-209ENST00000428120 PTH1RQ03431 593 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC87Q9NVE4 849 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 PALLDQ8WX93 1383 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 VPS72Q15906 364 aa28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 NUP98P52948 1817 aa28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 EIF5P55010 431 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
FAAP20-209ENST00000428120 A0A0D9SFI3 127 aa28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms