RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412333.1

MESTP4-201, Transcript of mesoderm specific transcript pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene MESTP4, Length 1,204 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESTP4-201ENST00000412333 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.1■□□□□ 0.01
MESTP4-201ENST00000412333 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
MESTP4-201ENST00000412333 FMNL2Q96PY5 1086 aa15.09■□□□□ 0.01
MESTP4-201ENST00000412333 PSMD1Q99460 953 aa15.09■□□□□ 0.01
MESTP4-201ENST00000412333 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.09■□□□□ 0.01
MESTP4-201ENST00000412333 ABCC12Q96J65 1359 aa15.09■□□□□ 0.01
MESTP4-201ENST00000412333 KCNQ3O43525 872 aa15.08■□□□□ 0
MESTP4-201ENST00000412333 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa15.07■□□□□ 0
MESTP4-201ENST00000412333 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
MESTP4-201ENST00000412333 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
MESTP4-201ENST00000412333 ALDH1B1P30837 517 aa15.07■□□□□ 0
MESTP4-201ENST00000412333 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.07■□□□□ 0
MESTP4-201ENST00000412333 NIM1KQ8IY84 436 aa15.06■□□□□ 0
MESTP4-201ENST00000412333 IL17REQ8NFR9 667 aa15.06■□□□□ 0
MESTP4-201ENST00000412333 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP15.06■□□□□ 0
MESTP4-201ENST00000412333 NUTM1Q86Y26 1132 aa15.05■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 GPRC5DQ9NZD1 345 aa15.05■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 USP16Q9Y5T5 823 aa15.05■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 AKAP11Q9UKA4 1901 aa15.05■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 PPIP5K2O43314 1243 aa15.04■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 AOC3Q16853 763 aa15.04■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.04■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 DLK2Q6UY11 383 aa15.04■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 BTBD11A6QL63 1104 aa15.03■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 GNAT3A8MTJ3 354 aa15.03■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 HUNKP57058 714 aa15.03■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 NOGQ13253 232 aa15.03■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 HLFQ16534 295 aa15.03■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 HHIPL1Q96JK4 782 aa15.03■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 NUP98P52948 1817 aa15.03■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa15.02■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP15.02■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 KNSTRNQ9Y448 316 aa15.02■□□□□ -0
MESTP4-201ENST00000412333 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.02□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 CRY2Q49AN0 593 aa15.01□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 TRPM4Q8TD43 1214 aa15.01□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 SHTN1A0MZ66 631 aa15□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 NBPF26B4DH59 902 aa15□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 TRPA1O75762 1119 aa15□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa15□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 NBPF15Q8N660 670 aa15□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 CXCL9Q07325 125 aa14.99□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 NGEFQ8N5V2 710 aa14.99□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.99□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.99□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 RIC1Q4ADV7 1423 aa14.99□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 NPM3O75607 178 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 RAD17O75943 681 aa14.98□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 USP48Q86UV5 1035 aa14.98□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.98□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 GPTP24298 496 aa14.97□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.97□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.97□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 NYXQ9GZU5 481 aa14.97□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 RNF186Q9NXI6 227 aa14.97□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 SAGE1Q9NXZ1 904 aa14.97□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.97□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 RGMBQ6NW40 437 aa14.96□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.96□□□□□ -0.01
MESTP4-201ENST00000412333 LAMB2P55268 1798 aa14.96□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 UBN2Q6ZU65 1347 aa14.94□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 ADM5C9JUS6 153 aa14.94□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 MICALL2Q8IY33 904 aa14.94□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.94□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 TAF1P21675 1872 aa14.93□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 GRIPAP1Q4V328 841 aa14.93□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 MCM10Q7L590 875 aa14.93□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.93□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 KIF7Q2M1P5 1343 aa14.92□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.92□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 SAMD7Q7Z3H4 446 aa14.92□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 KRT26Q7Z3Y9 468 aa14.92□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.92□□□□□ -0.02
MESTP4-201ENST00000412333 CRAMP1Q96RY5 1269 aa14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms