RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402096.5

ATG4B-204, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene ATG4B, Length 1,685 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-204ENST00000402096 LNPKQ9C0E8 428 aa25.48■■□□□ 1.67
ATG4B-204ENST00000402096 MTX1Q13505 466 aa25.47■■□□□ 1.67
ATG4B-204ENST00000402096 POLA2Q14181 598 aa25.47■■□□□ 1.67
ATG4B-204ENST00000402096 BCL11AQ9H165 835 aa25.47■■□□□ 1.67
ATG4B-204ENST00000402096 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.47■■□□□ 1.67
ATG4B-204ENST00000402096 EP400Q96L91 3159 aa25.47■■□□□ 1.67
ATG4B-204ENST00000402096 C4AP0C0L4 1744 aa25.46■■□□□ 1.67
ATG4B-204ENST00000402096 PHF14O94880 888 aa25.46■■□□□ 1.67
ATG4B-204ENST00000402096 EPHA10Q5JZY3 1008 aa25.46■■□□□ 1.67
ATG4B-204ENST00000402096 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.46■■□□□ 1.67
ATG4B-204ENST00000402096 PLSCR1O15162 318 aa25.45■■□□□ 1.67
ATG4B-204ENST00000402096 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.67
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.45■■□□□ 1.67
ATG4B-204ENST00000402096 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 ZPR1O75312 459 aa25.44■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 FAM89AQ96GI7 184 aa25.44■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.44■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 SURF6O75683 361 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 TRAPPC3LQ5T215 181 aa25.43■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 NARFQ9UHQ1 456 aa25.43■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.43■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 USPL1Q5W0Q7 1092 aa25.42■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 CLEC4GQ6UXB4 293 aa25.42■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 PROM2Q8N271 834 aa25.42■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.42■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa25.42■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 FAM177BA6PVY3 158 aa25.42■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 PDE4AP27815 886 aa25.42■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.42■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 MYH3P11055 1940 aa25.42■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 RFC4P35249 363 aa25.41■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 PARP10Q53GL7 1025 aa25.41■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 FOXO4P98177 505 aa25.4■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 LMBR1LQ6UX01 489 aa25.4■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 SUSD4Q5VX71 490 aa25.39■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.39■■□□□ 1.66
ATG4B-204ENST00000402096 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.39■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa25.39■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 ADRA2BP18089 450 aa25.38■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 BICDL1Q6ZP65 573 aa25.38■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 SYNE4Q8N205 404 aa25.38■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 RGL2O15211 777 aa25.37■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 RAB11FIP3O75154 756 aa25.37■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 BCL2L12Q9HB09 334 aa25.36■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 SH3TC1Q8TE82 1336 aa25.35■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.35■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 KLHDC4Q8TBB5 520 aa25.35■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.35■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 SSFA2P28290 1259 aa25.34■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP25.34■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 SIL1Q9H173 461 aa25.34■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 LAMB2P55268 1798 aa25.34■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa25.33■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 RHPN1Q8TCX5 695 aa25.33■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.33■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
ATG4B-204ENST00000402096 NTSR2O95665 410 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 KIF1BPQ96EK5 621 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 SETDB2Q96T68 719 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 PDE8AO60658 829 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 ZNF827Q17R98 1081 aa25.31■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 NUTM1Q86Y26 1132 aa25.31■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 CTSWP56202 376 aa25.3■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 COPRSQ9NQ92 184 aa25.3■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 FAM161AQ3B820 660 aa25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 AKT1S1Q96B36 256 aa25.29■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 CASZ1Q86V15 1759 aa25.28■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 CSF1RP07333 972 aa25.28■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.28■■□□□ 1.64
ATG4B-204ENST00000402096 MSH5O43196 834 aa25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms