RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 UVSSAQ2YD98 709 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 KCNB2Q92953 911 aa15.68■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP15.68■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP15.68■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 SASH1O94885 1247 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 PSMA5P28066 241 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 TERF1P54274 439 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 NECTIN1Q15223 517 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 CREB3L3Q68CJ9 461 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 UTYO14607 1347 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 NEXNQ0ZGT2 675 aa15.67■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 ATF3P18847 181 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 FAM227BQ96M60 508 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 FSD1Q9BTV5 496 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 SIL1Q9H173 461 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 MTMR6Q9Y217 621 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 SLIT3O75094 1523 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 RNF20Q5VTR2 975 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 MAP4K1Q92918 833 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 KAZALD1Q96I82 304 aa15.66■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 KIF1AQ12756 1690 aa15.65■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 ME3Q16798 604 aa15.65■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 BOLA2Q9H3K6 86 aa15.65■□□□□ 0.1
PRAME-201ENST00000398741 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 AXIN2Q9Y2T1 843 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 SLC27A2O14975 620 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 MYL6BP14649 208 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 CADPS2Q86UW7 1296 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 NECAB1Q8N987 351 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 USP25Q9UHP3 1055 aa15.64■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 IGKV5-2P06315 115 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 PDIA6Q15084 440 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 ANKRD1Q15327 319 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 ZNF790Q6PG37 636 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 A0A0D9SFI3 127 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 SLC39A6Q13433 755 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 TPCN1Q9ULQ1 816 aa15.63■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 DTNBO60941 627 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 KRT28Q7Z3Y7 464 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.092e-9■□□□□ 9.9
PRAME-201ENST00000398741 NEURL1BA8MQ27 555 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 PDCP20941 246 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 ST3GAL1Q11201 340 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 KLHL34Q8N239 644 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 KLHDC4Q8TBB5 520 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 MYD88Q99836 296 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 SNRKQ9NRH2 765 aa15.62■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 ERBB3P21860 1342 aa15.61■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 ADCY5O95622 1261 aa15.61■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 SLC52A2Q9HAB3 445 aa15.61■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 KRT85P78386 507 aa15.6■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 GCKRQ14397 625 aa15.6■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 GIMAP6Q6P9H5 292 aa15.6■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 COPS6Q7L5N1 327 aa15.6■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa15.6■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 RPS6KB1P23443 525 aa15.6■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 NLRP2Q9NX02 1062 aa15.6■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 HMG20BQ9P0W2 317 aa15.6■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 MED23Q9ULK4 1368 aa15.6■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 NPHP3Q7Z494 1330 aa15.59■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 UQCRHLA0A096LP55 91 aa15.59■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 UQCRHP07919 91 aa15.59■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
PRAME-201ENST00000398741 KDM4AO75164 1064 aa15.58■□□□□ 0.08
PRAME-201ENST00000398741 PLCB2Q00722 1185 aa15.58■□□□□ 0.08
PRAME-201ENST00000398741 EPHA10Q5JZY3 1008 aa15.58■□□□□ 0.08
PRAME-201ENST00000398741 CDC37L1Q7L3B6 337 aa15.58■□□□□ 0.08
PRAME-201ENST00000398741 FERMT3Q86UX7 667 aa15.58■□□□□ 0.08
PRAME-201ENST00000398741 TTC5Q8N0Z6 440 aa15.58■□□□□ 0.08
PRAME-201ENST00000398741 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa15.58■□□□□ 0.08
PRAME-201ENST00000398741 TCEANC2Q96MN5 208 aa15.58■□□□□ 0.08
PRAME-201ENST00000398741 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PRAME-201ENST00000398741 ALS2Q96Q42 1657 aa15.58■□□□□ 0.08
PRAME-201ENST00000398741 SASS6Q6UVJ0 657 aa15.58■□□□□ 0.08
PRAME-201ENST00000398741 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.58■□□□□ 0.08
PRAME-201ENST00000398741 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
PRAME-201ENST00000398741 MPNDQ8N594 471 aa15.58■□□□□ 0.08
PRAME-201ENST00000398741 FUCA2Q9BTY2 467 aa15.58■□□□□ 0.08
PRAME-201ENST00000398741 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.6 ms