RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384671.1

RNU6-959P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 959, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-959P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-959P-201ENST00000384671 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-959P-201ENST00000384671 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-959P-201ENST00000384671 DOLKQ9UPQ8 538 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-959P-201ENST00000384671 KCNH4Q9UQ05 1017 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-959P-201ENST00000384671 F8W735 103 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-959P-201ENST00000384671 RFC5P40937 340 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-959P-201ENST00000384671 OXLD1Q5BKU9 147 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-959P-201ENST00000384671 CBLL1Q75N03 491 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-959P-201ENST00000384671 WFDC8Q8IUA0 241 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-959P-201ENST00000384671 CEP63Q96MT8 703 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-959P-201ENST00000384671 SLC4A9Q96Q91 983 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-959P-201ENST00000384671 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-959P-201ENST00000384671 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-959P-201ENST00000384671 GLB1P16278 677 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 KCNQ4P56696 695 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 L3MBTL2Q969R5 705 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 NCANO14594 1321 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 TMEM229AB2RXF0 380 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 PRRG2O14669 202 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 PLAURQ03405 335 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 Q6ZS46 218 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 SIRT1Q96EB6 747 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 SFI1A8K8P3 1242 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 DHX15O43143 795 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 ITGB5P18084 799 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 FAM35AQ86V20 835 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 TRIM42Q8IWZ5 723 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 PHTF2Q8N3S3 785 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 LPIN3Q9BQK8 851 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 CPB1P15086 417 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 NOS2P35228 1153 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 RNF43Q68DV7 783 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 ARMC10Q8N2F6 343 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 HSH2DQ96JZ2 352 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 DBNDD2Q9BQY9 259 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 C7orf69Q9H7B7 122 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 HMX2A2RU54 273 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 B8ZZF3 427 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 TEAD4Q15561 434 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 LILRA6Q6PI73 481 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 RHPN1Q8TCX5 695 aa4.54□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 TYRO3Q06418 890 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 PERM1Q5SV97 790 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 SHKBP1Q8TBC3 707 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 FRRS1LQ9P0K9 344 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZNF232Q9UNY5 417 aa4.53□□□□□ -1.68
RNU6-959P-201ENST00000384671 GPR37L1O60883 481 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 PLCB2Q00722 1185 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 COL19A1Q14993 1142 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 SLFNL1Q499Z3 407 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZNF280CQ8ND82 737 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa4.52□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 TMEM259Q4ZIN3 620 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 TP53INP2Q8IXH6 220 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 TTC9Q92623 222 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 GSX2Q9BZM3 304 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 EFCC1Q9HA90 598 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 CCDC39Q9UFE4 941 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 CHIC2Q9UKJ5 165 aa4.51□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 WDR64B1ANS9 1081 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 NFKB1P19838 968 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 PCSK7Q16549 785 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 TBCELQ5QJ74 424 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 PNMA5Q96PV4 448 aa4.5□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZBTB42B2RXF5 422 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 PKN1Q16512 942 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 NFXL1Q6ZNB6 911 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 SUSD3Q96L08 255 aa4.49□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 SERTM1A2A2V5 107 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 BACH1O14867 736 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 SETDB1Q15047 1291 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 FBXL18Q96ME1 805 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 CEP41Q9BYV8 373 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 PIM2Q9P1W9 311 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 JAG2Q9Y219 1238 aa4.48□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 PAPLNO95428 1278 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 CCINQ13939 588 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 MSMPQ1L6U9 139 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 UVSSAQ2YD98 709 aa4.47□□□□□ -1.69
RNU6-959P-201ENST00000384671 CLEC10AQ8IUN9 316 aa4.47□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8 ms