RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380750.7

SERF1B-201, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 1,889 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-201ENST00000380750 MYT1Q01538 1121 aa29.8■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 LMBR1LQ6UX01 489 aa29.8■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 ARXQ96QS3 562 aa29.8■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 SIL1Q9H173 461 aa29.8■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 TTC41PQ6P2S7 1318 aa29.8■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa29.8■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 SLC4A3P48751 1232 aa29.79■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC87Q9NVE4 849 aa29.79■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 BECN1Q14457 450 aa29.78■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa29.78■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 ERVV-1B6SEH8 477 aa29.78■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 HLFQ16534 295 aa29.78■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 ITPK1Q13572 414 aa29.77■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 AFF2P51816 1311 aa29.77■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 CRKLP46109 303 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 EIF5P55010 431 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 RILPL2Q969X0 211 aa29.76■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.36
SERF1B-201ENST00000380750 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP29.76■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 AACSQ86V21 672 aa29.76■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 GPATCH3Q96I76 525 aa29.76■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP29.75■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 RREB1Q92766 1687 aa29.75■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 ECHDC1Q9NTX5 307 aa29.74■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 ERC2O15083 957 aa29.74■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa29.73■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 CHMP3Q9Y3E7 222 aa29.73■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 NLRP10Q86W26 655 aa29.72■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF831Q5JPB2 1677 aa29.72■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 REC8O95072 547 aa29.72■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 PLA2G12BQ9BX93 195 aa29.72■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 USP26Q9BXU7 913 aa29.72■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 ATRNO75882 1429 aa29.71■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 CHMLP26374 656 aa29.71■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 FAM89AQ96GI7 184 aa29.7■■■□□ 2.35
SERF1B-201ENST00000380750 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa29.7■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 GPTP24298 496 aa29.7■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 CNTROBQ8N137 903 aa29.7■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 CDHR2Q9BYE9 1310 aa29.69■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 KIF2CQ99661 725 aa29.69■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 TBC1D2Q9BYX2 928 aa29.69■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP29.69■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa29.68■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 TFCP2Q12800 502 aa29.68■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.68■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP29.67■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF34Q8IZ26 560 aa29.67■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 NUP98P52948 1817 aa29.66■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP29.65■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 TNNI3KQ59H18 835 aa29.65■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 PTF1AQ7RTS3 328 aa29.65■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa29.65■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 NHSQ6T4R5 1651 aa29.64■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 CSF1RP07333 972 aa29.64■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 ATG9AQ7Z3C6 839 aa29.64■■■□□ 2.34
SERF1B-201ENST00000380750 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 UBN2Q6ZU65 1347 aa29.63■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 CAMTA2O94983 1202 aa29.63■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 IL15P40933 162 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 LINC00116Q8NCU8 138 aa29.63■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 CIAO1O76071 339 aa29.62■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 CCDC57Q2TAC2 916 aa29.62■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 EYA2O00167 538 aa29.61■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 SYNE4Q8N205 404 aa29.61■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 SNX21Q969T3 373 aa29.61■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 FAM182BQ5T319 152 aa29.61■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 FBXO3Q9UK99 471 aa29.6■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 SEPT12Q8IYM1 358 aa29.59■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 EVI5LQ96CN4 794 aa29.59■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 GPR108Q9NPR9 543 aa29.59■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 BTAF1O14981 1849 aa29.59■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 AK9Q5TCS8 1911 aa29.59■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa29.59■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 LRRC24Q50LG9 513 aa29.58■■■□□ 2.33
SERF1B-201ENST00000380750 HSCBQ8IWL3 235 aa29.57■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 CTSWP56202 376 aa29.57■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 TTLL11Q8NHH1 800 aa29.57■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 PDE8AO60658 829 aa29.56■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 PARP10Q53GL7 1025 aa29.56■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 ATP5JP18859 108 aa29.55■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 KCNQ4P56696 695 aa29.55■■■□□ 2.32
SERF1B-201ENST00000380750 RABEP1Q15276 862 aa29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms