RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 CHRNA5P30532 468 aa19.63■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 G2E3Q7L622 706 aa19.63■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP19.63■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 SH3TC1Q8TE82 1336 aa19.62■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa19.62■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNA3P22001 575 aa19.62■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 ALDH1L2Q3SY69 923 aa19.62■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 ERFEQ4G0M1 354 aa19.62■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 NUTM1Q86Y26 1132 aa19.62■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC191Q8NCU4 936 aa19.62■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 MYD88Q99836 296 aa19.62■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 BCS1LQ9Y276 419 aa19.61■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 SRGNP10124 158 aa19.6■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC10A5Q5PT55 438 aa19.6■□□□□ 0.73
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PGGT1B-202ENST00000379615 CNKSR1Q969H4 720 aa19.6■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP19.6■□□□□ 0.73
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PGGT1B-202ENST00000379615 NLRP3Q96P20 1036 aa19.6■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 NPR1P16066 1061 aa19.59■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 SSH1Q8WYL5 1049 aa19.59■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 ADCY9O60503 1353 aa19.58■□□□□ 0.73
PGGT1B-202ENST00000379615 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
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PGGT1B-202ENST00000379615 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.58■□□□□ 0.72
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PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa19.57■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa19.57■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 ABCC12Q96J65 1359 aa19.57■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPRCP08575 1304 aa19.56■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 ALDH1B1P30837 517 aa19.56■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 CRY2Q49AN0 593 aa19.56■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 LINS1Q8NG48 757 aa19.56■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM89AQ96GI7 184 aa19.56■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa19.55■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa19.55■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 NEURL1BA8MQ27 555 aa19.54■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 IGKV5-2P06315 115 aa19.54■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP19.54■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 BCL2L13Q9BXK5 485 aa19.54■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP19.53■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 F6X3S4 739 aa19.52■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP19.52■□□□□ 0.72
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PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa19.52■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP19.52■□□□□ 0.72
PGGT1B-202ENST00000379615 ALDH1L1O75891 902 aa19.51■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 GCKRQ14397 625 aa19.51■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 BEND3Q5T5X7 828 aa19.51■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC4A10Q6U841 1118 aa19.51■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 SYNE4Q8N205 404 aa19.51■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 CRAMP1Q96RY5 1269 aa19.51■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 KIF16BQ96L93 1317 aa19.51■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa19.5■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 CDHR2Q9BYE9 1310 aa19.5■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 DLEC1Q9Y238 1755 aa19.49■□□□□ 0.71
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PGGT1B-202ENST00000379615 PDE8AO60658 829 aa19.49■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 C21orf2O43822 256 aa19.48■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 C3orf67Q6ZVT6 689 aa19.48■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa19.48■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGAP45Q92619 1136 aa19.48■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa19.47■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 BBOX1O75936 387 aa19.47■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa19.47■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC152Q4G0S7 254 aa19.46■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 GRIPAP1Q4V328 841 aa19.46■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP19.46■□□□□ 0.71
PGGT1B-202ENST00000379615 CCDC93Q567U6 631 aa19.45■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 TMC4Q7Z404 712 aa19.45■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 RTKN2Q8IZC4 609 aa19.45■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP19.45■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
PGGT1B-202ENST00000379615 GRM8O00222 908 aa19.44■□□□□ 0.7
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