RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377075.2

CNNM4-201, Transcript of cyclin and CBS domain divalent metal cation transport mediator 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNNM4, Length 4,800 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM4-201ENST00000377075 ANKRD24Q8TF21 1146 aa23.78■■□□□ 1.4
CNNM4-201ENST00000377075 GRM8O00222 908 aa23.77■■□□□ 1.4
CNNM4-201ENST00000377075 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CNNM4-201ENST00000377075 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CNNM4-201ENST00000377075 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CNNM4-201ENST00000377075 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
CNNM4-201ENST00000377075 CASQ1P31415 396 aa23.77■■□□□ 1.4
CNNM4-201ENST00000377075 IFNL2Q8IZJ0 200 aa23.77■■□□□ 1.4
CNNM4-201ENST00000377075 DNAJC25Q9H1X3 360 aa23.77■■□□□ 1.4
CNNM4-201ENST00000377075 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CNNM4-201ENST00000377075 CFAP43Q8NDM7 1665 aa23.77■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 CAVIN2O95810 425 aa23.76■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.76■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 CPA1P15085 419 aa23.76■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 G2E3Q7L622 706 aa23.76■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.76■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa23.76■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 TMEM67Q5HYA8 995 aa23.76■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 IQCA1Q86XH1 822 aa23.76■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 CEP135Q66GS9 1140 aa23.75■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 TRIM35Q9UPQ4 493 aa23.75■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 CHRNA2Q15822 529 aa23.75■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 A2MP01023 1474 aa23.74■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa23.74■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 SKILP12757 684 aa23.74■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 KSR2Q6VAB6 950 aa23.74■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 Q6ZUG5 572 aa23.74■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 KRT28Q7Z3Y7 464 aa23.74■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP23.74■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.74■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 CCDC148Q8NFR7 591 aa23.74■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 NCOA7Q8NI08 942 aa23.74■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 CRACR2AQ9BSW2 395 aa23.74■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.74■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.73■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 CCDC102BQ68D86 513 aa23.73■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.73■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa23.73■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.73■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 ALDH1L1O75891 902 aa23.72■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 KIAA0754O94854 1291 aa23.72■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 RDXP35241 583 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 SLC26A6Q9BXS9 759 aa23.72■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.72■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 IQCEQ6IPM2 695 aa23.72■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 TRERF1Q96PN7 1200 aa23.72■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 WDR62O43379 1518 aa23.72■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 ERLIN2O94905 339 aa23.72■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 SLC5A1P13866 664 aa23.72■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 SYT1P21579 422 aa23.72■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 EYA1Q99502 592 aa23.72■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP23.72■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 RBSNQ9H1K0 784 aa23.72■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 TYRO3Q06418 890 aa23.71■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 GBP3Q9H0R5 595 aa23.71■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 UNC13AQ9UPW8 1703 aa23.71■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 SYKP43405 635 aa23.7■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 GNG11P61952 73 aa23.7■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.39
CNNM4-201ENST00000377075 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 NLRP5P59047 1200 aa23.7■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 SPA17Q15506 151 aa23.7■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa23.7■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa23.7■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.7■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 TTC21AQ8NDW8 1320 aa23.7■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP23.7■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 ZMYND15Q9H091 742 aa23.7■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 DNA2P51530 1060 aa23.69■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 KLHL34Q8N239 644 aa23.69■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 LINS1Q8NG48 757 aa23.69■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 CHST3Q7LGC8 479 aa23.69■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 DTNBO60941 627 aa23.69■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 TAF3Q5VWG9 929 aa23.69■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa23.69■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.68■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.68■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.68■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 AOPEPQ8N6M6 819 aa23.68■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 MSH6P52701 1360 aa23.68■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.67■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 TAF4BQ92750 862 aa23.67■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 UBASH3AP57075 661 aa23.67■■□□□ 1.38
CNNM4-201ENST00000377075 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms