RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362821.1

RN7SKP173-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 173, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP173, Length 315 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP173-201ENST00000362821 CASP7P55210 303 aa10.74□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 PARP10Q53GL7 1025 aa10.74□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 CLEC4GQ6UXB4 293 aa10.74□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 SKAP1Q86WV1 359 aa10.74□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 ZNF34Q8IZ26 560 aa10.74□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP10.74□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 KAZALD1Q96I82 304 aa10.74□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 LNPKQ9C0E8 428 aa10.74□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 NARFQ9UHQ1 456 aa10.74□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 BCORQ6W2J9 1755 aa10.74□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 APBB1O00213 710 aa10.73□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 SURF6O75683 361 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 PHF14O94880 888 aa10.73□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 RFC4P35249 363 aa10.73□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 TRAPPC3LQ5T215 181 aa10.73□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP10.73□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa10.73□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 CDHR2Q9BYE9 1310 aa10.73□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP10.72□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa10.72□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 NUP98P52948 1817 aa10.72□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 RAB11FIP3O75154 756 aa10.72□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 SSFA2P28290 1259 aa10.72□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 EPHA10Q5JZY3 1008 aa10.72□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 ERC1Q8IUD2 1116 aa10.72□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 FAM89AQ96GI7 184 aa10.72□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 LRRCC1Q9C099 1032 aa10.72□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 CHMP3Q9Y3E7 222 aa10.72□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 UBN2Q6ZU65 1347 aa10.72□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 SH3TC1Q8TE82 1336 aa10.72□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 FOXO4P98177 505 aa10.71□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 USPL1Q5W0Q7 1092 aa10.71□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 LMBR1LQ6UX01 489 aa10.71□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 PLA2G12BQ9BX93 195 aa10.71□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 FAM177BA6PVY3 158 aa10.7□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 PDE4AP27815 886 aa10.7□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 SUSD4Q5VX71 490 aa10.7□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 PROM2Q8N271 834 aa10.7□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 KIF1BPQ96EK5 621 aa10.7□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 BCL11AQ9H165 835 aa10.7□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 C4AP0C0L4 1744 aa10.7□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 CTSWP56202 376 aa10.69□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 BICDL1Q6ZP65 573 aa10.69□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 SMIM5Q71RC9 77 aa10.69□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 AMIGO3Q86WK7 504 aa10.69□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 RHPN1Q8TCX5 695 aa10.69□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 SETDB2Q96T68 719 aa10.69□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 NYXQ9GZU5 481 aa10.69□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 COPRSQ9NQ92 184 aa10.69□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa10.69□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 UBR3Q6ZT12 1888 aa10.69□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 PDE8AO60658 829 aa10.68□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 NTSR2O95665 410 aa10.68□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP10.68□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 BAG6P46379 1132 aa10.68□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 CCDC57Q2TAC2 916 aa10.68□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 TAF7LQ5H9L4 462 aa10.68□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 TBC1D9BQ66K14 1250 aa10.68□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 FLAD1Q8NFF5 587 aa10.68□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 SIL1Q9H173 461 aa10.68□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 BCL2L12Q9HB09 334 aa10.68□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 CARMIL3Q8ND23 1372 aa10.67□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 NPHP1O15259 732 aa10.67□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 ZNF827Q17R98 1081 aa10.67□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 FAM161AQ3B820 660 aa10.67□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 SYNE4Q8N205 404 aa10.67□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 AKT1S1Q96B36 256 aa10.67□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 EP400Q96L91 3159 aa10.67□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 MSH5O43196 834 aa10.66□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 CSF1RP07333 972 aa10.66□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP10.66□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP10.66□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 TPTE2Q6XPS3 522 aa10.66□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 NUTM1Q86Y26 1132 aa10.66□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa10.66□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 TTLL11Q8NHH1 800 aa10.66□□□□□ -0.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 KLHDC4Q8TBB5 520 aa10.66□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms