RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360046.9

HOXA4-201, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXA4, Length 1,747 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-201ENST00000360046 NARFQ9UHQ1 456 aa27.38■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 ADRA2BP18089 450 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 USPL1Q5W0Q7 1092 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP27.37■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD44Q8N8A2 993 aa27.37■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 SIRT2Q8IXJ6 389 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP27.36■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 STK32BQ9NY57 414 aa27.36■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 MSH5O43196 834 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 NLRP10Q86W26 655 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 SUCLG2Q96I99 432 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 CLEC4GQ6UXB4 293 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.33■■□□□ 1.97
HOXA4-201ENST00000360046 SLC15A2Q16348 729 aa27.33■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 H7C1W4 665 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 HMMRO75330 724 aa27.32■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.32■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 RGL2O15211 777 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 FLAD1Q8NFF5 587 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 CASP7P55210 303 aa27.3■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 ATP8B2P98198 1209 aa27.3■■□□□ 1.96
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HOXA4-201ENST00000360046 PARP10Q53GL7 1025 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 KAZALD1Q96I82 304 aa27.29■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 FAM89AQ96GI7 184 aa27.28■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 FAM177BA6PVY3 158 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 SRGAP3O43295 1099 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.27■■□□□ 1.96
HOXA4-201ENST00000360046 EPHA10Q5JZY3 1008 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 SUSD4Q5VX71 490 aa27.26■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 GYS1P13807 737 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 MTX1Q13505 466 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 SMC5Q8IY18 1101 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 GCC1Q96CN9 775 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 SETDB2Q96T68 719 aa27.24■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 SSH3Q8TE77 659 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.23■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 SYNE4Q8N205 404 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 SH3TC1Q8TE82 1336 aa27.22■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 POLA2Q14181 598 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 DCTPP1Q9H773 170 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 COL24A1Q17RW2 1714 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 NTSR2O95665 410 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXA4-201ENST00000360046 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
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HOXA4-201ENST00000360046 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 LMBR1LQ6UX01 489 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 CHMP3Q9Y3E7 222 aa27.2■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 MYH3P11055 1940 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 NFIXQ14938 502 aa27.19■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 NUTM1Q86Y26 1132 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP27.18■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 PLA2G12BQ9BX93 195 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.18■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 APBB1O00213 710 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 SKAP1Q86WV1 359 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 NLGN1Q8N2Q7 840 aa27.17■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 ANKRD45Q5TZF3 282 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 NYXQ9GZU5 481 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 LAMB2P55268 1798 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 QSER1Q2KHR3 1735 aa27.16■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 NPHP1O15259 732 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 PDE8AO60658 829 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 SURF6O75683 361 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 MSL1Q68DK7 614 aa27.15■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 NUCB1Q02818 461 aa27.14■■□□□ 1.94
HOXA4-201ENST00000360046 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 CTSWP56202 376 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 ERFEQ4G0M1 354 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 TPTE2Q6XPS3 522 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 TM4SF1P30408 202 aa27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 CHD1LQ86WJ1 897 aa27.12■■□□□ 1.93
HOXA4-201ENST00000360046 BCL11AQ9H165 835 aa27.12■■□□□ 1.93
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