RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 FAM227BQ96M60 508 aa25.69■■□□□ 1.7
PTDSS1-201ENST00000337004 ORAI2Q96SN7 254 aa25.69■■□□□ 1.7
PTDSS1-201ENST00000337004 RNF20Q5VTR2 975 aa25.68■■□□□ 1.7
PTDSS1-201ENST00000337004 NEXNQ0ZGT2 675 aa25.68■■□□□ 1.7
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PTDSS1-201ENST00000337004 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.67■■□□□ 1.7
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PTDSS1-201ENST00000337004 TPCN1Q9ULQ1 816 aa25.66■■□□□ 1.7
PTDSS1-201ENST00000337004 AXIN2Q9Y2T1 843 aa25.66■■□□□ 1.7
PTDSS1-201ENST00000337004 SLIT3O75094 1523 aa25.66■■□□□ 1.7
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PTDSS1-201ENST00000337004 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
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PTDSS1-201ENST00000337004 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
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PTDSS1-201ENST00000337004 NPHP3Q7Z494 1330 aa25.56■■□□□ 1.68
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PTDSS1-201ENST00000337004 TCHHQ07283 1943 aa25.55■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 ELP1O95163 1332 aa25.55■■□□□ 1.68
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PTDSS1-201ENST00000337004 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.55■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa25.55■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 TAF5LO75529 589 aa25.54■■□□□ 1.68
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PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 PIBF1Q8WXW3 757 aa25.54■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 NLRP2Q9NX02 1062 aa25.54■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 JCADQ9P266 1359 aa25.54■■□□□ 1.68
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PTDSS1-201ENST00000337004 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
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PTDSS1-201ENST00000337004 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.53■■□□□ 1.68
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PTDSS1-201ENST00000337004 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.52■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 DYNC1I1O14576 645 aa25.52■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 PLCB2Q00722 1185 aa25.52■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 TNNI3KQ59H18 835 aa25.52■■□□□ 1.68
PTDSS1-201ENST00000337004 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
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