RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa24.56■■□□□ 1.52
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CCDC71-201ENST00000321895 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.49■■□□□ 1.51
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CCDC71-201ENST00000321895 ZNF827Q17R98 1081 aa24.49■■□□□ 1.51
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CCDC71-201ENST00000321895 SUSD4Q5VX71 490 aa24.48■■□□□ 1.51
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC125Q86Z20 511 aa24.47■■□□□ 1.51
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CCDC71-201ENST00000321895 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.47■■□□□ 1.51
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CCDC71-201ENST00000321895 SH3TC1Q8TE82 1336 aa24.46■■□□□ 1.51
CCDC71-201ENST00000321895 NTSR2O95665 410 aa24.46■■□□□ 1.51
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CCDC71-201ENST00000321895 CHD1LQ86WJ1 897 aa24.45■■□□□ 1.5
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CCDC71-201ENST00000321895 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
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CCDC71-201ENST00000321895 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.42■■□□□ 1.5
CCDC71-201ENST00000321895 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.42■■□□□ 1.5
CCDC71-201ENST00000321895 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CCDC71-201ENST00000321895 FAM177BA6PVY3 158 aa24.42■■□□□ 1.5
CCDC71-201ENST00000321895 PDE8AO60658 829 aa24.42■■□□□ 1.5
CCDC71-201ENST00000321895 LNPKQ9C0E8 428 aa24.42■■□□□ 1.5
CCDC71-201ENST00000321895 NYXQ9GZU5 481 aa24.42■■□□□ 1.5
CCDC71-201ENST00000321895 CSF1RP07333 972 aa24.41■■□□□ 1.5
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CCDC71-201ENST00000321895 RGS3P49796 1198 aa24.4■■□□□ 1.5
CCDC71-201ENST00000321895 CTSWP56202 376 aa24.4■■□□□ 1.5
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CCDC71-201ENST00000321895 COPRSQ9NQ92 184 aa24.4■■□□□ 1.5
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CCDC71-201ENST00000321895 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.4■■□□□ 1.5
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CCDC71-201ENST00000321895 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP24.39■■□□□ 1.49
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CCDC71-201ENST00000321895 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CCDC71-201ENST00000321895 TTLL11Q8NHH1 800 aa24.38■■□□□ 1.49
CCDC71-201ENST00000321895 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
CCDC71-201ENST00000321895 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.38■■□□□ 1.49
CCDC71-201ENST00000321895 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
CCDC71-201ENST00000321895 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.37■■□□□ 1.49
CCDC71-201ENST00000321895 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.37■■□□□ 1.49
CCDC71-201ENST00000321895 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
CCDC71-201ENST00000321895 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.37■■□□□ 1.49
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