RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314583.7

HCLS1-201, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCLS1, Length 2,000 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-201ENST00000314583 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.47■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 H7C1W4 665 aa22.47■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 STARD3NLO95772 234 aa22.46■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 VPS72Q15906 364 aa22.46■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC191Q8NCU4 936 aa22.46■■□□□ 1.19
HCLS1-201ENST00000314583 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa22.45■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 SGSM2O43147 1006 aa22.45■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 RUFY2Q8WXA3 655 aa22.45■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 CERKQ8TCT0 537 aa22.45■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 EVI5LQ96CN4 794 aa22.45■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 MCM2P49736 904 aa22.44■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 C8orf37Q96NL8 207 aa22.43■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 SIL1Q9H173 461 aa22.43■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.43■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 MCM4P33991 863 aa22.43■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 GSE1Q14687 1217 aa22.43■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 RREB1Q92766 1687 aa22.43■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 RAD50Q92878 1312 aa22.42■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 HIP1O00291 1037 aa22.42■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 NGLY1Q96IV0 654 aa22.42■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.42■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.42■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.41■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 HSPA4P34932 840 aa22.41■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 FOXO4P98177 505 aa22.4■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.4■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.4■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.4■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa22.4■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 TCIRG1Q13488 830 aa22.4■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
HCLS1-201ENST00000314583 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.39■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.39■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.39■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 IL25Q9H293 177 aa22.38■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.38■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 NEK4P51957 841 aa22.38■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.38■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 GBP4Q96PP9 640 aa22.38■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 PALD1Q9ULE6 856 aa22.38■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.37■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.37■■□□□ 1.17
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HCLS1-201ENST00000314583 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.37■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.37■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.36■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 PTMSP20962 102 aa22.36■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 TFCP2Q12800 502 aa22.35■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 ATP5JP18859 108 aa22.35■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 NUCB2P80303 420 aa22.35■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.34■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 GPR108Q9NPR9 543 aa22.34■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.34■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.33■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 USP21Q9UK80 565 aa22.33■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
HCLS1-201ENST00000314583 SNRKQ9NRH2 765 aa22.33■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 PALLDQ8WX93 1383 aa22.33■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.32■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 NUP98P52948 1817 aa22.32■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.31■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 CIAO1O76071 339 aa22.31■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 SIK1P57059 783 aa22.31■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 CLEC17AQ6ZS10 378 aa22.31■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.31■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 HLFQ16534 295 aa22.31■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 FSD1Q9BTV5 496 aa22.31■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 FBXO3Q9UK99 471 aa22.31■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.3■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 HSPA1LP34931 641 aa22.3■■□□□ 1.16
HCLS1-201ENST00000314583 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.3■■□□□ 1.16
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