RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 TMEM87AQ8NBN3 555 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 SMC3Q9UQE7 1217 aa23.49■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 CYP27B1O15528 508 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 MAP4K1Q92918 833 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 PHF14O94880 888 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 PSMA5P28066 241 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 CABP4P57796 275 aa23.48■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 RNF20Q5VTR2 975 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 RBSNQ9H1K0 784 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 USP16Q9Y5T5 823 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 ERBB4Q15303 1308 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 HS1BP3Q53T59 392 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 SIL1Q9H173 461 aa23.47■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 STX6O43752 255 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 KCNJ4P48050 445 aa23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 FSD1Q9BTV5 496 aa23.45■■□□□ 1.35
SPNS1-201ENST00000311008 CREB3L3Q68CJ9 461 aa23.45■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 SYCE3A1L190 88 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 SYT1P21579 422 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 CHRNA2Q15822 529 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 CABLES1Q8TDN4 633 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 FAM227BQ96M60 508 aa23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 ATP5JP18859 108 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 ADCK5Q3MIX3 580 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 USP48Q86UV5 1035 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 KLHL34Q8N239 644 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD1Q15327 319 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 HMG20BQ9P0W2 317 aa23.43■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 MED23Q9ULK4 1368 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 PDLIM2Q96JY6 352 aa23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 LAMB4A4D0S4 1761 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 SLC27A2O14975 620 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 F13A1P00488 732 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 KLHDC4Q8TBB5 520 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 JCADQ9P266 1359 aa23.41■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 TNNI3KQ59H18 835 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 ZSCAN30Q86W11 494 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 A0A087WZG4 1122 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 CPA1P15085 419 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.4■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 A0A0D9SFI3 127 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 GJB2P29033 226 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 TSPY26PQ9H489 355 aa23.39■■□□□ 1.34
SPNS1-201ENST00000311008 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.39■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 UBE2HP62256 183 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 TICAM2Q86XR7 235 aa23.38■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 LARGE1O95461 756 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 CASP7P55210 303 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 TFCP2Q12800 502 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 KRT32Q14532 448 aa23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 WDR17Q8IZU2 1322 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 ME3Q16798 604 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 GLI3P10071 1580 aa23.36■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 PDCP20941 246 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC183Q5T5S1 534 aa23.35■■□□□ 1.33
SPNS1-201ENST00000311008 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.35■■□□□ 1.33
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