RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NFIXQ14938 502 aa25.56■■□□□ 1.68
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 NEURL1BA8MQ27 555 aa25.55■■□□□ 1.68
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.5■■□□□ 1.67
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 MEIS3Q99687 375 aa25.47■■□□□ 1.67
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.47■■□□□ 1.67
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 MTFR1LQ9H019 292 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.46■■□□□ 1.67
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa25.44■■□□□ 1.66
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.4■■□□□ 1.66
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCC12Q96J65 1359 aa25.39■■□□□ 1.65
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 SUCLG2Q96I99 432 aa25.39■■□□□ 1.65
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 ST5P78524 1137 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RGS3P49796 1198 aa25.32■■□□□ 1.64
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
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SH3BGRL3-201ENST00000270792 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.31■■□□□ 1.64
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