RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261497.8

USP22-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP22, Length 5,220 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP22-201ENST00000261497 KSR2Q6VAB6 950 aa16.03■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 VEZTQ9HBM0 779 aa16.03■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 TRPM2O94759 1503 aa16.03■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 NPATQ14207 1427 aa16.03■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa16.03■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 DESP17661 470 aa16.03■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 ZNF804AQ7Z570 1209 aa16.03■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 PRDM10Q9NQV6 1147 aa16.03■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 TMEM266Q2M3C6 531 aa16.03■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 GRM8O00222 908 aa16.02■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 MFSD6Q6ZSS7 791 aa16.02■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 GOLGA6L10A6NI86 522 aa16.02■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 CYP7A1P22680 504 aa16.02■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 HAND2P61296 217 aa16.02■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 IP6K1Q92551 441 aa16.02■□□□□ 0.16
USP22-201ENST00000261497 EYA1Q99502 592 aa16.02■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 ALDH1L1O75891 902 aa16.02■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 EYA3Q99504 573 aa16.02■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 TMEM67Q5HYA8 995 aa16.01■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 UBA5Q9GZZ9 404 aa16.01■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 ATP10AO60312 1499 aa16.01■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 USP21Q9UK80 565 aa16.01■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 DNAI2Q9GZS0 605 aa16■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 PICALMQ13492 652 aa16■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 MAP3K19Q56UN5 1328 aa16■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 HOXC9P31274 260 aa16■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 IL15P40933 162 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 CBX1P83916 185 aa16■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.99■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.99■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 GUCY1B3Q02153 619 aa15.99■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 CNBD1Q8NA66 436 aa15.99■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 LINS1Q8NG48 757 aa15.99■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 RHPN1Q8TCX5 695 aa15.99■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 SPDYE4A6NLX3 237 aa15.99■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 RIMBP2O15034 1052 aa15.99■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 BAG4O95429 457 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 MICU3Q86XE3 530 aa15.99■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 NEBLO76041 1014 aa15.98■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 BAG6P46379 1132 aa15.98■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 ADAMTS12P58397 1594 aa15.98■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 CCT2P78371 535 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 EIF5P55010 431 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 TXLNBQ8N3L3 684 aa15.98■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 CCDC102AQ96A19 550 aa15.98■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 NUP62CLQ9H1M0 184 aa15.98■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 SAMM50Q9Y512 469 aa15.98■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 KIAA0556O60303 1618 aa15.98■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 LIG1P18858 919 aa15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 UBXN4Q92575 508 aa15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 CENPHQ9H3R5 247 aa15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 ERLIN2O94905 339 aa15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 TSPY3P0CV98 308 aa15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 TSPY8P0CW00 308 aa15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 IARSP41252 1262 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 MEIS3Q99687 375 aa15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 NEFHP12036 1026 aa15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 USP16Q9Y5T5 823 aa15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 NUP160Q12769 1436 aa15.96■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 POTEJP0CG39 1038 aa15.96■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 NCOA7Q8NI08 942 aa15.96■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 FAM193AP78312 1265 aa15.96■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.96■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 MAP3K5Q99683 1374 aa15.96■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 TRAF1Q13077 416 aa15.96■□□□□ 0.15
USP22-201ENST00000261497 CCDC181Q5TID7 509 aa15.96■□□□□ 0.14
USP22-201ENST00000261497 TSHZ3Q63HK5 1081 aa15.96■□□□□ 0.14
USP22-201ENST00000261497 ABCC1P33527 1531 aa15.96■□□□□ 0.14
USP22-201ENST00000261497 RNMTO43148 476 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
USP22-201ENST00000261497 CBFA2T2O43439 604 aa15.95■□□□□ 0.14
USP22-201ENST00000261497 C8orf58Q8NAV2 365 aa15.95■□□□□ 0.14
USP22-201ENST00000261497 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa15.95■□□□□ 0.14
USP22-201ENST00000261497 VTI1AQ96AJ9 217 aa15.95■□□□□ 0.14
USP22-201ENST00000261497 APBA3O96018 575 aa15.95■□□□□ 0.14
USP22-201ENST00000261497 ANKRD2Q9GZV1 360 aa15.95■□□□□ 0.14
USP22-201ENST00000261497 GJA3Q9Y6H8 435 aa15.95■□□□□ 0.14
USP22-201ENST00000261497 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.1 ms