RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259239.7

IMP4-201, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IMP4, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-201ENST00000259239 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 NLRP10Q86W26 655 aa22.19■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 SRGAP3O43295 1099 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 MTX1Q13505 466 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 SSH3Q8TE77 659 aa22.18■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 PHF14O94880 888 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 POLA2Q14181 598 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 RGS3P49796 1198 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.17■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 NUCB1Q02818 461 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 NARFQ9UHQ1 456 aa22.16■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 FAM89AQ96GI7 184 aa22.15■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.15■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.14■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 USPL1Q5W0Q7 1092 aa22.14■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.14■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
IMP4-201ENST00000259239 LAMB2P55268 1798 aa22.14■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 APBB1O00213 710 aa22.14■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 ZPR1O75312 459 aa22.14■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 TRAPPC3LQ5T215 181 aa22.14■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.14■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.14■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 CHD1LQ86WJ1 897 aa22.13■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 LNPKQ9C0E8 428 aa22.13■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 CASZ1Q86V15 1759 aa22.13■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 FOXO4P98177 505 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 SYNE4Q8N205 404 aa22.12■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 RGL2O15211 777 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 ADRA2BP18089 450 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 RFC4P35249 363 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 SUSD4Q5VX71 490 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 FAM177BA6PVY3 158 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 PDE4AP27815 886 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 ZNF827Q17R98 1081 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 PARP10Q53GL7 1025 aa22.11■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 SSFA2P28290 1259 aa22.1■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 LMBR1LQ6UX01 489 aa22.1■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 BCL11AQ9H165 835 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 CHMP3Q9Y3E7 222 aa22.09■■□□□ 1.13
IMP4-201ENST00000259239 NTSR2O95665 410 aa22.08■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 AKT1S1Q96B36 256 aa22.08■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 CAMKK2Q96RR4 588 aa22.08■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.08■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 SH3TC1Q8TE82 1336 aa22.07■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 KLHDC4Q8TBB5 520 aa22.06■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.06■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.06■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.04■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 SIL1Q9H173 461 aa22.04■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 RAB11FIP3O75154 756 aa22.03■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 BAG6P46379 1132 aa22.03■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.03■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 SETDB2Q96T68 719 aa22.03■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 QSER1Q2KHR3 1735 aa22.03■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 PDE8AO60658 829 aa22.03■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 CTSWP56202 376 aa22.03■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 CSF1RP07333 972 aa22.02■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 GYS1P13807 737 aa22.02■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 FAM161AQ3B820 660 aa22.02■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 DEFB132Q7Z7B7 95 aa22.02■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.02■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 COPRSQ9NQ92 184 aa22.02■■□□□ 1.12
IMP4-201ENST00000259239 SPEF2Q9C093 1822 aa22.01■■□□□ 1.11
IMP4-201ENST00000259239 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.01■■□□□ 1.11
IMP4-201ENST00000259239 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
IMP4-201ENST00000259239 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.01■■□□□ 1.11
IMP4-201ENST00000259239 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
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