RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236192.11

VAMP4-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP4, Length 5,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4-201ENST00000236192 CLSTN2Q9H4D0 955 aa14.78□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 LMNTD2Q8IXW0 634 aa14.78□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 USP16Q9Y5T5 823 aa14.78□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 FRMD3A2A2Y4 597 aa14.78□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 WWC2Q6AWC2 1192 aa14.78□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 TAX1BP1Q86VP1 789 aa14.78□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 IRAK4Q9NWZ3 460 aa14.78□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa14.78□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 FGD5Q6ZNL6 1462 aa14.77□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 SURF6O75683 361 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 MAATS1Q7Z4T9 603 aa14.77□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa14.77□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.77□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 EVC2Q86UK5 1308 aa14.77□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 ETF1P62495 437 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 RABGGTAQ92696 567 aa14.77□□□□□ -0.04
VAMP4-201ENST00000236192 PAFAH1B1P43034 410 aa14.77□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 STIM1Q13586 685 aa14.77□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa14.77□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 DBN1Q16643 649 aa14.77□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa14.77□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 TMPOP42166 694 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 FSD1Q9BTV5 496 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 CCT5P48643 541 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 KRT32Q14532 448 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 NBPF6Q5VWK0 638 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 NBPF4Q96M43 638 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 CHUKO15111 745 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 TRAK1Q9UPV9 953 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 BIN1O00499 593 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 LONRF2Q1L5Z9 754 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 FAM204AQ9H8W3 233 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 ST7Q9NRC1 585 aa14.76□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 KIF3BO15066 747 aa14.75□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 BCAS4Q8TDM0 211 aa14.75□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.75□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 CCDC38Q502W7 563 aa14.75□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.75□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 DAPK1P53355 1430 aa14.75□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 IFFO1Q0D2I5 559 aa14.74□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.74□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 FAN1Q9Y2M0 1017 aa14.74□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa14.74□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 PPFIA1Q13136 1202 aa14.74□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 IQCA1Q86XH1 822 aa14.74□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa14.74□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 CPLX3Q8WVH0 158 aa14.74□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa14.74□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.74□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 SAAL1Q96ER3 474 aa14.74□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 YEATS4O95619 227 aa14.74□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 CAPS2Q9BXY5 557 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 GOLGA6BA6NDN3 693 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 GNGT1P63211 74 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 TOP2BQ02880 1626 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 RAB11FIP3O75154 756 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 SPECC1Q5M775 1068 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 FBF1Q8TES7 1133 aa14.73□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 ARHGAP45Q92619 1136 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 LZTFL1Q9NQ48 299 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa14.72□□□□□ -0.05
VAMP4-201ENST00000236192 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms