RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227756.4

GALNT18-201, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 18, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GALNT18, Length 2,504 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT18-201ENST00000227756 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
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GALNT18-201ENST00000227756 RASEFQ8IZ41 740 aa20.39■□□□□ 0.85
GALNT18-201ENST00000227756 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
GALNT18-201ENST00000227756 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.38■□□□□ 0.85
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GALNT18-201ENST00000227756 PTH1RQ03431 593 aa20.37■□□□□ 0.85
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GALNT18-201ENST00000227756 CHMP3Q9Y3E7 222 aa20.36■□□□□ 0.85
GALNT18-201ENST00000227756 UBR2Q8IWV8 1755 aa20.36■□□□□ 0.85
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GALNT18-201ENST00000227756 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
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GALNT18-201ENST00000227756 CCDC171Q6TFL3 1326 aa20.32■□□□□ 0.84
GALNT18-201ENST00000227756 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
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GALNT18-201ENST00000227756 DBNDD2Q9BQY9 259 aa20.29■□□□□ 0.84
GALNT18-201ENST00000227756 NUP188Q5SRE5 1749 aa20.29■□□□□ 0.84
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GALNT18-201ENST00000227756 RUFY3Q7L099 469 aa20.29■□□□□ 0.84
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GALNT18-201ENST00000227756 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa20.29■□□□□ 0.84
GALNT18-201ENST00000227756 PANK2Q9BZ23 570 aa20.28■□□□□ 0.84
GALNT18-201ENST00000227756 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa20.28■□□□□ 0.84
GALNT18-201ENST00000227756 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa20.28■□□□□ 0.84
GALNT18-201ENST00000227756 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
GALNT18-201ENST00000227756 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.28■□□□□ 0.84
GALNT18-201ENST00000227756 MAP4K1Q92918 833 aa20.28■□□□□ 0.84
GALNT18-201ENST00000227756 GRPEL1Q9HAV7 217 aa20.28■□□□□ 0.84
GALNT18-201ENST00000227756 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
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GALNT18-201ENST00000227756 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.27■□□□□ 0.84
GALNT18-201ENST00000227756 DNAJC10Q8IXB1 793 aa20.27■□□□□ 0.84
GALNT18-201ENST00000227756 KCNB2Q92953 911 aa20.27■□□□□ 0.84
GALNT18-201ENST00000227756 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
GALNT18-201ENST00000227756 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
GALNT18-201ENST00000227756 SNRKQ9NRH2 765 aa20.26■□□□□ 0.83
GALNT18-201ENST00000227756 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.26■□□□□ 0.83
GALNT18-201ENST00000227756 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa20.26■□□□□ 0.83
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GALNT18-201ENST00000227756 ATG3Q9NT62 314 aa20.25■□□□□ 0.83
GALNT18-201ENST00000227756 VPS53Q5VIR6 699 aa20.25■□□□□ 0.83
GALNT18-201ENST00000227756 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
GALNT18-201ENST00000227756 TJP1Q07157 1748 aa20.25■□□□□ 0.83
GALNT18-201ENST00000227756 SLC27A2O14975 620 aa20.24■□□□□ 0.83
GALNT18-201ENST00000227756 TCIRG1Q13488 830 aa20.24■□□□□ 0.83
GALNT18-201ENST00000227756 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
GALNT18-201ENST00000227756 ISCA1Q9BUE6 129 aa20.24■□□□□ 0.83
GALNT18-201ENST00000227756 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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