RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 LDLRP01130 860 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 GSNP06396 782 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 RNF224P0DH78 156 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 DCTP40126 519 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 MDH1P40925 334 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 GAS1P54826 345 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 CASP9P55211 416 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 FLYWCH1Q4VC44 716 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 EIPR1Q53HC9 387 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 WLSQ5T9L3 541 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 OR5M10Q6IEU7 315 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 C3P1Q6ZMU1 363 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 ZNF621Q6ZSS3 439 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 MARCH3Q86UD3 253 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 IFNEQ86WN2 208 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 RNF130Q86XS8 419 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 GATSQ8NAP1 163 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 ZNF527Q8NB42 609 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 FAM110BQ8TC76 370 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 MIPOL1Q8TD10 442 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 SPDL1Q96EA4 605 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 OR2B2Q9GZK3 357 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 RABEP2Q9H5N1 569 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 HHATLQ9HCP6 504 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 UBQLN4Q9NRR5 601 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 EXD2Q9NVH0 621 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 TMEM45AQ9NWC5 275 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 CCDC167Q9P0B6 97 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 FBXL2Q9UKC9 423 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 ACAD8Q9UKU7 415 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 MEMO1Q9Y316 297 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 NINQ8N4C6 2090 aa8.4□□□□□ -1.06
NELFE-214ENST00000625905 ZNF407Q9C0G0 2248 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 ALG1L2C9J202 215 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 NPIPA7E9PJI5 369 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 DYNC1I1O14576 645 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 ADAM10O14672 748 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 NDUFB5O43674 189 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 GMFGO60234 142 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 ZG16O60844 167 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 KRT75O95678 551 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 NPIPA8P0DM63 369 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 OR12D1P0DN82 309 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 TBXA2RP21731 343 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 DPP4P27487 766 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 SRD5A2P31213 254 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 GANABQ14697 944 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 GTDC1Q4AE62 458 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 AGKQ53H12 422 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 ZNF585AQ6P3V2 769 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 SLC2A7Q6PXP3 512 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 RPTNQ6XPR3 784 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 MISPQ8IVT2 679 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 ZNF614Q8N883 585 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 FADS6Q8N9I5 356 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 OR2M3Q8NG83 312 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 OR5M9Q8NGP3 310 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 OR4C3Q8NH37 302 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 RAB8BQ92930 207 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 CCDC120Q96HB5 630 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 SFXN2Q96NB2 322 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 ZNF350Q9GZX5 532 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 HOXD1Q9GZZ0 328 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 DSN1Q9H410 356 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 PTGES2Q9H7Z7 377 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 PNPLA3Q9NST1 481 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 FBXO34Q9NWN3 711 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 TAS2R10Q9NYW0 307 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 KCNE3Q9Y6H6 103 aa8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 DNAJC13O75165 2243 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 A0A096LPI6 279 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 A0A1W2PQD3 144 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 E9PLN8 166 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 H3BNH8 94 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 KIAA0513O60268 411 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 WDR1O75083 606 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 TNFRSF21O75509 655 aa8.38□□□□□ -1.07
NELFE-214ENST00000625905 STX11O75558 287 aa8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms