RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 C1QL4Q86Z23 238 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 NUDCD3Q8IVD9 361 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SLC38A6Q8IZM9 456 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 LINC00518Q8N0U6 118 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 GCNT2Q8N0V5 402 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 CLDN19Q8N6F1 224 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF321PQ8N8H1 164 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 LRRC57Q8N9N7 239 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF527Q8NB42 609 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 APCDD1LQ8NCL9 501 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 C11orf65Q8NCR3 313 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 B3GNT7Q8NFL0 401 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 OR5T1Q8NG75 326 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 OR2L3Q8NG85 312 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 OR4K2Q8NGD2 314 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 OR2A1Q8NGT9 310 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 OR2W6PQ8NHA6 318 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 HUS1BQ8NHY5 278 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 LHFPL5Q8TAF8 219 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 C10orf105Q8TEF2 133 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 TSPEARQ8WU66 669 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 CAPSLQ8WWF8 208 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 CKAP2Q8WWK9 683 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PYDC1Q8WXC3 89 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ASB11Q8WXH4 323 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ELMO1Q92556 727 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 FAM168AQ92567 244 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 TANKQ92844 425 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 NEUROG1Q92886 237 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 WNT2BQ93097 391 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 BORCS5Q969J3 196 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 FBXW5Q969U6 566 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 VPS33AQ96AX1 596 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 RAD51AP1Q96B01 352 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 TADA1Q96BN2 335 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ULK4Q96C45 1275 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SLC25A36Q96CQ1 311 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 STARD4Q96DR4 205 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 HES6Q96HZ4 224 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 MAGEB18Q96M61 343 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 NSMCE2Q96MF7 247 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 BTBD9Q96Q07 612 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 OR1F2PQ96R84 312 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 RASL10BQ96S79 203 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SLC30A3Q99726 388 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 BCL7BQ9BQE9 202 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 TMEM204Q9BSN7 226 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 NTMT1Q9BV86 223 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PRR14Q9BWN1 585 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 GON7Q9BXV9 100 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 STK33Q9BYT3 514 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 CEP41Q9BYV8 373 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 C1orf21Q9H246 121 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 LRMDAQ9H2I8 198 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 Q9H521 79 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ALG2Q9H553 416 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SYNPO2LQ9H987 977 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SPACA1Q9HBV2 294 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ANKHQ9HCJ1 492 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ZFP64Q9NPA5 681 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SAR1AQ9NR31 198 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 LANCL2Q9NS86 450 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 UFSP2Q9NUQ7 469 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 NUDT15Q9NV35 164 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 DNAJC11Q9NVH1 559 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 UBP1Q9NZI7 540 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 MYOTQ9UBF9 498 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PCYOX1Q9UHG3 505 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 FKBPLQ9UIM3 349 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 TRHDEQ9UKU6 1024 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PCDHB10Q9UN67 800 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ERGIC3Q9Y282 383 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 SLC6A5Q9Y345 797 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ATG4BQ9Y4P1 393 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 DMRT1Q9Y5R6 373 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 ACTL7BQ9Y614 415 aa2.19□□□□□ -2.06
SNORD53-201ENST00000579969 IGLV3-16A0A075B6K0 115 aa2.18□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms