RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR1J4Q8NGS1 313 aa30.26■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf72A6NCS6 295 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM166BA8MTA8 275 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 EVPLLA8MZ36 301 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 MRASO14807 208 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNPHO15079 494 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCTN3O75935 186 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPPAP01160 153 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 RUNDC3AQ59EK9 446 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 TREML1Q86YW5 311 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM109AQ8N4B1 249 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM251Q8N6I4 163 aa30.25■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD27Q96NW4 1050 aa30.25■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 SDHAF3Q9NRP4 125 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 P2RX2Q9UBL9 471 aa30.25■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa30.24■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GNB5O14775 395 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 EDN3P14138 238 aa30.24■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 AP1ARQ63HQ0 302 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 APOOLQ6UXV4 268 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 POU5F2Q8N7G0 328 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 GNRHR2Q96P88 292 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC37BQ96QE4 947 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPIPA1Q9UND3 350 aa30.24■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDR45Q9Y484 360 aa30.24■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FCMRO60667 390 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 BMP2P12643 396 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 COX4I1P13073 169 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGEA5P43359 124 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP12AP54707 1039 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXK1P85037 733 aa30.23■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 MARCH3Q86UD3 253 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 WDSUB1Q8N9V3 476 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR137Q96N19 417 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 RTN4RQ9BZR6 473 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 QPCTLQ9NXS2 382 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 MKLN1Q9UL63 735 aa30.23■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PQD3 144 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPIPB9F8W1W9 429 aa30.22■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR68Q15743 365 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYPL1Q16563 259 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAP130Q9H0E3 1048 aa30.22■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 C15orf41Q9Y2V0 281 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 NCKAP5O14513 1909 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP30.22■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ANGPTL1O95841 491 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 NR2F1P10589 423 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 C17orf67Q0P5P2 114 aa30.22■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 CMPK2Q5EBM0 449 aa30.22■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKFN1Q8N957 763 aa30.22■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 UBQLN3Q9H347 655 aa30.22■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 GDF1P27539 372 aa30.21■■■□□ 2.43
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CTDNEP1-209ENST00000574205 FRRS1Q6ZNA5 592 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 OLIG3Q7RTU3 272 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 GALNT11Q8NCW6 608 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 GID8Q9NWU2 228 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 SEC14L3Q9UDX4 400 aa30.21■■■□□ 2.43
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM247A6NEH6 219 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 TNFRSF21O75509 655 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 CBR3O75828 277 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 WISP2O76076 250 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLHL26Q53HC5 615 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATCAYQ86WG3 371 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZGRF1Q86YA3 2104 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 MISPQ8IVT2 679 aa30.2■■■□□ 2.42
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF619Q8N2I2 560 aa30.2■■■□□ 2.42
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